作者你好,那么接下来怎么做KEGG富集呢?用enrichKEGG的话,没有organism
自己构建物种包OrgDb,然后用clusterProfiler富集分析利用clusterProfiler进行富集分析时,发现网上没有物种包OrgDb,利用网上教程构建了一个。主要参考了刘小泽的简书,特别感谢一下!!! emapper首先得到注释...
作者你好,请问”eggNOG annot“是sesame.emapper.annotations文件中的列名吗?
构建自己物种的orgDb1.首先安装eggnog-mapper软件 注释所需要的物种数据库网址如下,同时也可以用里面的脚本download_eggnog_data.py下载你所需要的数据库: egg...
参考 BGI-online网站[https://www.bgionline.cn/docs.html#/handbook/introduction]使用BGI Online ...
中国茶树原产地中心新论[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1MjcwMDE4NQ==&mid=2247486326&idx=1&sn=f...
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HR全基因组关联鉴定与茶叶滋味相关的分子标记[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1MjcwMDE4NQ==&mid=2247485306...
代码链接:Upset plot展示韦恩图[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1MjcwMDE4NQ==&mid=2247485042&i...
茶树PPI网络数据库[http://www.360doc.com/content/21/0127/22/71039787_959293228.shtml]