@荣_e687 你可以看看你的gene2go这张表里是不是有GO号不对
转录组分析(11) - GO/KEGG富集分析(1)简介 bioconductor介绍[http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/clusterProfil...
@荣_e687 你可以看看你的gene2go这张表里是不是有GO号不对
转录组分析(11) - GO/KEGG富集分析(1)简介 bioconductor介绍[http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/clusterProfil...
定量都是用BAM文件
转录组分析(5) - 无参转录组拼接(illumina)目的 NGS测序得到的短序列(read)存储于Fastq文件,在经过DNA建库和测序之后,文件中不同read之间的顺序就全部丢失了。因此,Fastq文件中紧挨着的两条read...
1.下载frp 下载系统对应的frp 安装包[https://github.com/fatedier/frp/releases] 2.安装jupyte 3.配置IP 端口 在...
对于没有Org.Db的非模式生物,由于某些原因不制作Org.Db,然后利用clusterProfiler做富集 数据格式 数据准备 富集分析绘图
远程服务 R packages(待补充) 预装插件 包的安装
1.下载 进入清华大学开源软件镜像站[https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/],点击获取下载链接,在应用软件种选择最新版本的Minicon...
简介 bioconductor介绍[http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/clusterProfil...
@文艺眼镜狗 conda是在shell
转录组分析(2) - 软件安装conda环境创建 conda create -n py3 python=3.8conda create -n py2 python=2.7 数据预处理软件 conda ac...
真核生物大部分基因含有内含子,转录完成后产生的mRNA前体需要经过一系列复杂的加工,成为成熟的mRNA,转移到细胞质中才能发挥功能。可变剪接(Alternative Spli...
对比(Mapping)就是通过局部比对将短的reads定位到参考基因组上,以共后续分析使用。序列比对的过程包括:首先对参考基因组建立索引,建立索引之后,利用比对软件将clea...
变量间的关系可以分为两种:函数关系与相关关系。函数关系是一一对应的确定关系,然而实际中变量间的关系往往比较复杂,数量关系不确定,这种变量间的不确定的数量关系称为相关关系。相关...
方差分析(analysis of variation, ANOVA) 又称变异数分析或F检验,用于两个及两个以上样本均值差别的显著性检验,其目的是推断两组或多组数据的总体均值...
推断统计是研究如何利用样本数据来推断总体特征的统计方法,其特点是根据速记的观测样本数据以及问题的条件和假定,对未知事物作出的以概率形式表述的推断。推断性统计有四个理论部分:概...
假设总体的分布函数的类型已知,但是其中的一个或者多个参数未知,那么往往就需要对这些未知的参数做出合理的估计,并且对所做出的估计进行评价,这样的过程就叫做参数估计。参数估计是统...
推断性统计学是用样本(历史数据)的估计量(离散型或连续型)推断总体(将来)的对应的参数值(离散型或连续型)。推断性统计学有概率理论、抽样理论、估计理论和假设检验理论四个理论组...
一、基因家族基础知识与研究思路介绍 1.基因家族简介 基因是染色体上一段可以发生转录的区域(内含子外显子启动子)。转录本才是基因的研究实体,转录本transcript(别名 ...
推断统计是研究如何利用样本数据来推断总体特征的统计方法,其特点是根据速记的观测样本数据以及问题的条件和假定,对未知事物作出的以概率形式表述的推断。推断性统计有四个理论部分:概...