1.微卫星不稳定性（MSI） 1.1 微卫星序列MS序列，是一些短而重复的DNA序列，串联重复排列，又称短串联重复（short tandem repeat,STR），常见类型...
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NGS018 微卫星不稳定性
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NGS016 单细胞测序（下）第一部分详见： NGS015 单细胞测序（上） 3 单细胞平台介绍 3.1 Missionbio Tapestri Plateform 3.1.1 工作机理 3.1.2 ...
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NGS015 单细胞测序（上）1 背景介绍 1.1 发展历程 全球单细胞测序技术研发从 2009 年开始起步，里程碑事件是汤富酬教授发表了世界第一篇单细胞mRNA 测序的文章。国内单细胞测序技术的应用从 ...
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Linux009 Ubuntu软件安装
Linux软件通常都是存放在存储库中，并通过包（Package）的形式进行分发。处理包的工作被称为包管理。包提供了操作系统的基本组件，以及共享的库、应用程序、服务和文档。常用...
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R.002 安装R及RstudioInstalling R and RStudio - Easy R Programming[http://www.sthda.com/english/wiki/install...
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Linux016 linux常用命令缩写
pwd:print work directory 打印当前目录，显示出当前工作目录的绝对路径df: disk free，显示磁盘可用空间数目信息及空间结点信息。du: Dis...
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全基因组扩增方法汇总全基因组扩增技术（Whole genome amplification，WGA）能够实现对整个基因组的扩增以提供大量可供分析样品的技术 1.基于PCR 技术的WGA 方法 1...
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R006 基本图形-饼图pie()与扇形图fan.plot()饼图 饼图可由函数pie()创建 例 扇形图 饼图让比较各扇形的值变得困难（除非这些值被附加在标签上），为改善这种状况，我们创造了一种称为扇形图（fan.plot）的饼图变种...
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荧光定量PCR（一）— 基础介绍1.荧光基础 1.1 荧光的产生 当有入射光照射物质时，其分子会吸收入射光的能量从而受到激发使得其电子由低能级跃迁至高能级，此时处于激发态的分子其结构并不稳定，会通过跃迁而失...
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荧光定量PCR（二） — 引物与探针
1.引物设计的基本原则是什么？ 引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 引物长度一般在15-30碱基之间。 引物GC含量在40%-60%之间，Tm值最好接近72 ℃。 引物3...
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R009 基本图形-条形图barplot()条形图通过垂直的或水平的条形展示了类别型变量的分布（频数）。 1.用法 Usage 2.主要参数 参数含义height描述组成图的条的向量或值矩阵。如果高度是向量，则绘图由一...
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R011 基本图形-箱线图boxplot()箱线图（又称盒须图）通过绘制连续型变量的五数总括，即最小值、下四分位数（第25百分位数）、中位数（第50百分位数）、上四分位数（第75百分位数）以及最大值，描述了连续型变量的...
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R010 基本图形-直方图hist()直方图通过在x轴上将值域分割为一定数量的组，在y轴上显示相应值的频数，展示了连续型变量的分布。可以使用hist()函数创建直方图 hist()用法 hist(x, break...
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R015 R语言控制流（for，while，ifelse，switch）
控制流在正常情况下，R程序中的语句是从上至下顺序执行的。但有时你可能希望重复执行某些语句，仅在满足特定条件的情况下执行另外的语句。这就是控制流结构发挥作用的地方了。R拥有一般...
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R014 变量处理常用函数
1.变量转换 is.datatype()：判断变量种类 as.datatype()：转换变量类型其中，datatype可以为numeric，character，vector，...
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R007 基本图形-点图dotchart()点图提供了一种在简单水平刻度上绘制大量有标签值的方法。你可以使用dotchart()函数创建点图，格式为dotchart(x,labels =)其中的x是一个数值向量，而la...
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ggplot2 002 快速绘图qplot()http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-essentials 1.介绍 ggplot2是功能强大且灵活的R包，由Hadley Wi...
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ggplot2 001 图形语法ggplot2是R语言最流行的第三方扩展包，包名中“gg”是图形语法（grammar of graphics）的简称，Wickham Hadley将这套语法诠释如下：一张统计...
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ggplot2 007 点图，散点图，带状图1.Dot plots 1.1 语法 geom_dotplot( mapping = NULL, data = NULL, position = "identity", .....