分离体分组混合分析法(Bulked Sergeant Analysis, BSA)也称为集群分离分析法或混合分组分析法,是从近等基因系分析法演变而来的。常规的育种通常从近等基...
分离体分组混合分析法(Bulked Sergeant Analysis, BSA)也称为集群分离分析法或混合分组分析法,是从近等基因系分析法演变而来的。常规的育种通常从近等基...
官方网站:https://itol.embl.de/[https://itol.embl.de/] ITOL是Interaction Tree Of Life(网址:http...
研究基因组加倍、WGD、古多倍化的专家列表:人员名单来源:https://wap.sciencenet.cn/blog-3459184-1268104.html?mobile...
写在前面 Emmm,前面推送了几期好基友-比较基因组小王子的 WGDI 软件使用和比较基因组图表解读。后台常常受到消息,大体意思“快更新!”。原本,我和小王子商量的是一周一更...
安装kakscalculator2 kakscalculator2下载地址[https://sourceforge.net/projects/kakscalculator2/...
Genomic analyses of primitive, wild and cultivated citrus provide insights into asexual...
背景篇 MITE属于II类非自主转座因子,并且在真核生物中存在大量的拷贝。 MITE长度大约是500bp,并且扩增速度非常快。2013年一篇发表在NAR的文章"P-MITE:...
基因组中重复序列大体分为两类:串联重复(Tandem repeats,Tandem Duplication) (TRF可预测)散在重复(Dispersed repeats),...
基因组注释第一步:重复序列注释 串联重复序列(卫星序列) :特定的单元首尾相连特定的单元散落:散在重复序列(转座子) 分类: 卫星序列 :重复序列长度大于100bp小卫星序列...
重复序列广泛存在于真核生物基因组中, 这些重复序列或集中成簇, 或分散在基因之间。根据分布把重复序列分为散在重复序列和串联重复序列。 重复序列的分类 重复序列注释流程 参考脚...
RepeatMasker二.再次学习 2023年3月16日 9:28 近期通过看文献和接触到的新的重复序列注释工具,对RepeatMasker的使用理解加深了一点点,对重复序...
转座子鉴定方法 转座子的鉴定方法基本归于两大类:从头预测、基于同源比对。 从头预测算法 de novo 包括:基于基因组序列比对的方法、K-mer 方法、基于结构特征的方法基...
https://www.baidu.com/s?wd=EDTA%20%20%20LTR&rsv_spt=1&rsv_iqid=0xf6737f5d00006e15&issp=...
基因组结构注释主要包括三个方面:从头注释(de novo prediction)、同源注释(homology-based prediction)以及基于转录组数据注释(tra...
参考链接 如何对基因组进行注释[https://www.jianshu.com/p/931e9821c45a] 从头预测,同源注释和转录组整合都会得到一个预测结果,相当于收集...
一句话评价:重复序列注释用EDTA就完事了。 简介 EDTA, 全称是 Extensive de-novo TE Annotator, 一个综合性的流程工具,它整合了目前LT...
01—研究背景 记得在两年前刚学生信时,和很多小伙伴一样,在做完差异基因分析或者进行基因特异性筛选时,发现结果有几百个甚至上千个基因。心里想,这么多基因,如果每一个基因去NC...
NCBI CDD地址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/bwrpsb/bwrpsb.cgi[https://www.ncbi.nl...