分离体分组混合分析法（Bulked Sergeant Analysis, BSA）也称为集群分离分析法或混合分组分析法，是从近等基因系分析法演变而来的。常规的育种通常从近等基...
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遗传统计|BSA-seq混合分组鉴定功能基因 -
7.2 GWAS：系统进化树美化——ITOL官方网站：https://itol.embl.de/[https://itol.embl.de/] ITOL是Interaction Tree Of Life（网址：http...
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WGDI | 比较基因组分析神器，要啥有啥！写在前面 Emmm，前面推送了几期好基友-比较基因组小王子的 WGDI 软件使用和比较基因组图表解读。后台常常受到消息，大体意思“快更新！”。原本，我和小王子商量的是一周一更...
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使用KaKs_calculator计算Ka/Ks
安装kakscalculator2 kakscalculator2下载地址[https://sourceforge.net/projects/kakscalculator2/...
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2019-09-22
Genomic analyses of primitive, wild and cultivated citrus provide insights into asexual...
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「基因组注释」MITE-Hunter鉴别基因组的MITE序列背景篇 MITE属于II类非自主转座因子，并且在真核生物中存在大量的拷贝。 MITE长度大约是500bp，并且扩增速度非常快。2013年一篇发表在NAR的文章"P-MITE:...
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转座子（TE,散在重复）特征及其对基因组影响基因组中重复序列大体分为两类：串联重复（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可预测）散在重复（Dispersed repeats），...
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RepeatMasker注释重复序列二RepeatMasker二.再次学习 2023年3月16日 9:28 近期通过看文献和接触到的新的重复序列注释工具，对RepeatMasker的使用理解加深了一点点，对重复序...
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EDTA | TE 注释工具https://www.baidu.com/s?wd=EDTA%20%20%20LTR&rsv_spt=1&rsv_iqid=0xf6737f5d00006e15&issp=...
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基因组结构注释软件列表
基因组结构注释主要包括三个方面：从头注释（de novo prediction）、同源注释（homology-based prediction）以及基于转录组数据注释（tra...
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基因结构注释（4）：整合预测结果参考链接 如何对基因组进行注释[https://www.jianshu.com/p/931e9821c45a] 从头预测，同源注释和转录组整合都会得到一个预测结果，相当于收集...
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EDTA | TE注释一句话评价：重复序列注释用EDTA就完事了。 简介 EDTA, 全称是 Extensive de-novo TE Annotator, 一个综合性的流程工具，它整合了目前LT...
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富集分析结果展示（一）——气泡图01—研究背景 记得在两年前刚学生信时，和很多小伙伴一样，在做完差异基因分析或者进行基因特异性筛选时，发现结果有几百个甚至上千个基因。心里想，这么多基因，如果每一个基因去NC...
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运用NCBI CDD预测结构域NCBI CDD地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/bwrpsb/bwrpsb.cgi[https://www.ncbi.nl...
