实验室新服务器需要安装cellranger，发现最新版（3.1.0）与旧版（1.2.0）有点差别，故整理流程如下： 1. 下载安装 1.1下载地址 1.2 安装指南 1.2....
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单细胞转录组之cellranger探索——1.安装
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共线性分析那些事
今天和大家聊一聊共线性分析。 共线性 共线性研究的是同源基因或者序列的排布关系，比较常见的是组装基因组文章中，通过同源性比较来评估基因组的组装效果以及同源基因的保留和丢失的情...
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聊聊“基因组共线性”最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送，发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念，前者主要是基于蛋白水平，蛋白的保守性很...
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动植物基因组组装（华中农已毕业的生物狗）的分析小经验，不定时记录日常搬砖踩坑记录，欢迎互相交流学习~<br>学无止境，温故而知新~
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生信分析学习笔记 - RNAseq （二） 双端测序与单端测序声明：本文部分内容和部分图片来源于网络。本文为生信小白学习笔记，不能保证专业名词和内容全部正确或权威。 下图为某一条RNAseq从数据预处理，序列回帖到数据可视化...
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GSEAGSEA背景 比如你读到一篇文献，里面的作者设计了一系列实验，其中一个实验是，knock down基因X，对WT和KD进行RNA-seq实验，比较WT和KD的表达谱的变化，从...
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优美胜于丑陋，明了胜于晦涩，简洁胜于复杂。<br>复杂胜于凌乱，扁平胜于嵌套，间隔胜于紧凑。
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生信技能树蛋白组文章汇总
1. 蛋白质组学第1期-认识基础概念 2. 蛋白质组学第2期-认识蛋白质组学原始数据 3. 蛋白质组学第3期-蛋白质组学的三大元素 4. 蛋白质组学第4期-文章搜库过程复现 ...
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mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal！ 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的表达矩阵数据，但是无论是自身实验需要，还是从NCBI的GEO...
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湿实验伤手，干实验伤脑，干湿结合可能会更好。
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生信技能树线上课程：RNA-seq写在前面 很荣幸参加生信技能树全国巡讲-第一站-重庆站的RNA-seq线下培训课程。以下为线下课结合线上课所做的笔记，希望能帮到你。 一些小练习题 下面开始RNA-seq流程...
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转录组分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
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GEO芯片联合分析批次校正combat/limma批次校正的原因和方法 校正批次效应这篇说可以用combat来进行批次校正校正批次效应这篇说limma和combat都可以ComBat or removebatcheffect...
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一只烟酒僧
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