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更新:20190319 使用EasyCodeML完成dnds的计算,自己尝试了分支模型和位点模型的计算,简直不要太容易! 更新:20190314 教程 http://wiki...
系统发育树的构建 现有的方法 系统发育树构建方法的优劣 link 选择:一般情况下,若有合适的分子进化模型可供选择,用最大似然法构树获得的结果较好;对于近缘物种序列,通常情况...
请问楼主,在计算多个样本某一基因的ka/ks的时候,是挨个计算每个样本的某个基因,再求平均值,还是把所有的样本连成一条序列,一起算一个值呢?
用以判断选择压力的Ka/Ks的计算前言 最近在看一些关于生态、遗传、基因组进化等的文献,其中有个很多人用的也用了很久的用以判断物种选择压力的数值,(Ka/Ks)。发现在国内的资料中比较少,即使有,也只是教大家...
在群体遗传学中衡量群体间的遗传分化的程度的指标有许多种,较为常见的就是遗传分化指数(Fst),fst是由F统计量演变而来,F统计量主要有三种(FIS,FIF,FST)。Fst...