论文 Pan-genome inversion index reveals evolutionary insights into the subpopulation stru...

论文 Pan-genome inversion index reveals evolutionary insights into the subpopulation stru...
写在前面 类似的主题,我们已经推出了一篇主题为《一键完成共线性(MCScanX)分析》的文章。推出之后一部分人用着挺好。也有相当部分朋友却不知为何遇到各种各样的问题。这些问题...
可以通过 seqkit这个软件实现,
【python脚本】计算fasta序列长度;基因组contig/scaffold/chromosome长度目的 如题 脚本 来源:https://blog.csdn.net/tangxc10/article/details/48833989?utm_medium=distribu...
已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在线工具Idiographica,虽然能绘制直的...
最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送,发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念,前者主要是基于蛋白水平,蛋白的保守性很...
1) Projects always take longer than expected. There are inevitable delays and bumps in ...
主要记载一些生信大佬们的博客地址,以供学习与查询。我常用的一些博客、论坛,在这里没有记录,因为经常用,记得住。大家自己搜索下,生信技能树、生信菜鸟团、陈连福老师的博客和bio...
GWAS找到显著信号位点后,需要解释显著信号位点如何影响表型。常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括: 1)GWAS和eQTL共定位; 2)GWAS和sQTL...
论文是 Bioactivity descriptors for uncharacterized chemical compounds 本地存储文件名 s41467-021-2...
2021年9月10日,中科院深海所联合西北工业大学(西工大),青岛华大基因研究院(青岛华大)等多家科研机构,在《美国科学院院刊》(Proceedings of the Nat...
“SnapGene是模拟质粒构建的利器。” SnapGene是一款功能强大的多功能的分子生物学工具,能够非常直观的注释分析和DNA图谱,用于创建和共享丰富的注释文件,帮助我们...
Misztal, I., Aguilar, I., Lourenco, D., Ma, L., Steibel, J. P., & Toro, M. (2021). Emer...
这算是笔记。。。。 前提是总vcf文件已经用snpeff注释过了
不同于分类和回归,聚类不需要事先的任何参考分类信息,可以简单地通过判断数据特征的相似性来完成对数据的归类。 层次聚类不需要事先指定族的个数,以系统树的形式展现。 k均值聚类扁...