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发简信
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【ProteoWizard MSConvert】质谱文件格式简介及其转换质谱格式 质谱文件格式多种多样，各仪器厂商产出的数据都有不同。虽然HUPO已经对质谱数据进行了标准化，但大家依然是我行我素，因为不得不用它们提供的软件，而不同的软件会要求不同...
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个人wx公众号：木舟笔记。
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我的还是出现了错误
install.packages("Vennerable", repos="http://R-Forge.R-project.org";)
WARNING: Rtools is required to build R packages but is not currently installed. Please download and install the appropriate version of Rtools before proceeding:
https://cran.rstudio.com/bin/windows/Rtools/
还安装相依关系‘gtools’
Package which is only available in source form, and may need compilation of
C/C++/Fortran: ‘gtools’
These will not be installed
安装源码包‘Vennerable’
trying URL 'http://R-Forge.R-project.org/src/contrib/Vennerable_3.0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1727552 bytes (1.6 MB)
downloaded 1.6 MB
ERROR: dependency 'gtools' is not available for package 'Vennerable'
* removing 'D:/software/R-4.1.3/library/Vennerable'
Warning in install.packages :
installation of package ‘Vennerable’ had non-zero exit status
The downloaded source packages are in
‘C:\Users\bomengdi\AppData\Local\Temp\RtmpiqwGME\downloaded_packages.Vennerable包的安装
直接使用install.packages("Vennerable", repos="http://R-Forge.R-project.org")命令安装Vennerable包...
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人丑就要多读书呀
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Mfuzz的使用
最近在进行ATAC和RNA-Seq的联合分析，由于处理的材料是时间相关的，所以time-course也是一个可以分析的点。在一位刘潜老哥的帮助下，我找到了一篇靠谱熊 转录组时...
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只有一个样本的话就会只有一个count吗，我前面用star align后只有一个bam文件（一开始也只有两个fastq.gz 双端测序）
mRNA-seq学习（三）：htseq-count计数
htseq-count计数的相关内容前面在不同的学习阶段写过两次，分别是合并htseq-count的结果得到count matrix和htseq-count的一个坑，其中第二...
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理解SAM文件格式以及过滤sam文件RNA-seq或者ChIP-seq等等测序的上游分析流程里的比对步骤相信大家都知道，我之前也只是按照各种教程去走流程，并没有仔细的研究过每一步的内容。今天这篇文章学习一下sa...
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没有生成‘’Aligned.toTranscriptome.out.bam‘’这个文件是什么问题
转录组分析 | 使用STAR进行比对
欢迎关注微信公众号“生信小王子”！ 前几期，小编已经教大家完成了RNA-seq数据的质控，下面就要正式开始转录组分析啦！ 通过二代测序我们可以获得150bp左右的reads，...
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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reads长度是从哪知道的，是指转录组数据的reads长度吗
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RNA-seq(5):序列比对：Hisat2比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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PCA降维原理PCA原理简介 为什么要用PCA? 维基百科介绍：主成分分析（英语：Principal components analysis，PCA）是一种分析、简化数据集的技术。主成分分...
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take notes of practical work skills for myself
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咖啡豆的处理方式有哪些记得刚入咖啡坑那会，在网上选购咖啡豆，傻傻分不清 咖啡信息下面写的“处理方式”这一栏是什么意思 比如常见的 水洗处理 日晒处理 ，蜜处理，最开始接触咖啡后置处理的时候，我也被...
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