你好,是得到的Tassel关联文件直接画曼哈顿图吗
GWAS全基因组关联分析流程(BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel)我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来...
你好,是得到的Tassel关联文件直接画曼哈顿图吗
GWAS全基因组关联分析流程(BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel)我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来...
你好,用KO号查找途径的时候 怎么选择物种
非模式生物KEGG富集分析写在前面 因为我研究的物种比较小众,很多注释不完全,R包AnnotationHub中也没有对应信息,所以无法使用公共数据库进行kegg富集分析。所以自己尝试使用KAAS造一个...
您好 你的问题解决了吗
rMATs的介绍及用法具体的介绍和使用方法及原理:使用rmats进行可变剪切的分析(摘自生信修炼手册) 原理:我理解的原理是他利用了3-4个外显子,检测哪个是exon inclusion isof...
您好 b1 后面接的是对照组的样本吗
rMATS寻找可变剪切可变剪切: 软件: 地址:http://rnaseq-mats.sourceforge.net/user_guide.htm python rmats.py --b1 b1....
您好 请问一下哪一步用到表型数据了
跑通GWAS,用这些脚本就够了最近跑通了一遍GWAS分析,全程在linux操作,虽然具体还有好多需要微调的地方,先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈推荐百迈客云课堂课程GWAS生...