HISAT2是一个快速和敏感的比对软件,用于将二代测序数据(DNA和RNA)比对到基因组数据。 官网:http://daehwankimlab.github.io/hisat...
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HISAT2是一个快速和敏感的比对软件,用于将二代测序数据(DNA和RNA)比对到基因组数据。 官网:http://daehwankimlab.github.io/hisat...
一、准备RNA-seq数据 需要参考基因组文件,注释文件,样本的fastq.gz文件 检查fastq.gz是否完整 二、fastqc生成质量报告(multiqc 提高查看效率...
转载:https://biozx.top/hisat2.html[https://biozx.top/hisat2.html] HISAT2是TopHat2/Bowti2的继...
一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM tools 课上已经用sudo a...