创建circexplorer3环境 python版本需为2.7+ 软件版本问题 注意：Samtools=0.1.18.0，Bowtie=1.0.0.0，tophat=2.0....
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CIRCexplorer3 | 踩坑之路
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融合基因检测 tophat-fusion 报错 "basic_exception.h:236 FAILED" 解决方案
tags： tophat-fusion tophat-fusion 报错 RNA-seq 数据检测融合基因，在 tophat-fusion 这一步报错： 第一次运行的是 to...
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生信坑底躺着不动的男人<br>简书不常在，有问题可私信
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那令人困惑的比对工具选择啊~
写在前面的废话 我可能不适合做科研，因为我总是对一些“没有必要”的事斤斤计较~ 刚开始接触二代测序时，是跟着Jimmy大神从RNA-seq开始入门的。那时候使用的比对工具是H...
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bedtools 安装与使用
bedtools软件一款强大的基因组数据处理工具集，如序列提取，合并，拆分等 1、软件的安装两种方式 第一种下载软件安装，进入到自己存放软件的文件夹 下载完后解压 mkae ...
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[转载]RNAseq: TopHat2 + Cufflinks分析流程
[转载]RNA-seq :TopHat2 + Cufflinks分析流程 测序数据质量控制：fastqc软件 使用方法： 参数说明：-o: 输出文件所在目录，并且是已经存在的...
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Hisat2 安装hisat2的安装 1.下载 运行结果 2.解压 结果 一般源代码安装需编译后再安装，编译前需要检查配置，即执行./configure命令来完成，但hisat2不需要执行./...
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优雅地做一名极客
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2018-06-15 如何加快（一点点）从NCBI上下载数据的速度
之前要下载一个大数据，从NCBI上下载比较慢，听了洲更建议，我就去ENA上下载，确实，下载很人性化，而且还有一个java的下载器，速度快，还方便选择。 但是，最近我突然无法从...
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如何在NCBI下载数据（包括批量下载）？NCBI（National Center for Biotechnology Information）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/[https:...
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一条小咸鱼
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对抗样本之FGSM原理&实战
目录1、FGSM原理2、pytorch实现2.1 建立模型2.2 FGSM模块2.3 测试2.4 可视化对比2.5 对比样本与对抗样本 1、FGSM原理 论文 Explain...
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深度学习&PyTorch 之 DNN-回归
前面文章[https://shenzl.blog.csdn.net/article/details/128617956]讲了PyTorch的基本原理，本篇正式用PyTorch...
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把写作当成一种修行
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「文献05」深度学习应用于基因组学的入门指导日期：2019年2月2日——2019-Week5分类：「综述+资源」题目：A primer on deep learning in genomicsDOI: https://...
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最近不常登陆简书，若评论问题没有及时回复，可以发邮件交流 bioinfortime@163.com
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