相信大家都做过基因的功能富集分析,小编前面也花了不少篇幅给大家介绍GO和KEGG富集分析 ☞GO和KEGG富集分析视频讲解[https://link.zhihu.com/?t...
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对于miRNA靶基因的预测而言,目前有很多数据库都可以做。这些数据库的区别基本上在于纳入的数据量以及预测的算法不同。预测的结果总是有一些不同的,所以也就导致各个数据库的结果可...
导读 利用富集分析,我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如:TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
KEGG Bar plot 以bar的颜色和高度体现enrichment scores(比如pvalue),gene counts或者ratio作为bar Dot plot ...
近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,国自然资助的项目数量也逐年上升。 m6A是什么,m6A调控因子、m6...
前言 在研究某基因的功能时,常常要用到某基因的过表达,或敲除,或敲低。 在敲除方面,常用的就是Crispir/Cas9技术,不过此技术周期比较长,步骤比较麻烦,就我们实验室而...
tRNA作为蛋白质翻译中氨基酸的转运小能手,发挥着至关重要的作用。而另一个有关tRNA的特殊之处在于其及其丰富的修饰数量与类型。一个成熟的tRNA仅约72nt,平均每个t...
RNA缩略词详解 lncRNA:长链非编码RNA(long non-coding RNA) miRNA:微小RNA(microRNA) circRNA:环状RNA(circu...
有m7g的课吗
现在的纯生信不是复制代码就可以发表的以前的纯生信都是看到一篇文章,模仿复现就可以轻松发表。但是现在没有这么简单了,因为期刊对纯生信要求越来越高了,甚至连1-2分的水刊都知道要创新。如果期刊editor发现文章是...
为什么有些人总是能发好几篇纯生信SCI?因为人家掌握了方法,例如利用同一份GEO数据可以发两篇SCI,具体操作如下: 第一篇纯生信SCI可以这样做: 第一步,数据下载处理、合...
1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA,它...
近年来,长非编码RNA(lncRNAs)在人类疾病中的作用越来越受重视。目前已有的lncRNA数据库信息大都集中在lncRNAs的基本信息和功能特性上,关于关键下游靶点、ln...
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您好,这个是不是要跑很久,大概多久,我跑了一个多小时还没出来
构建lncRNA对输入文件 输出文件