一起疯狂学习GIS！
发简信
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答读者问~使用R语言利用SSR数据构建进化树今天公众号的一位读者留言问有了SSR的数据，如何画树状图？ SSR的数据我也是第一次接触，我看了一下他发给我的数据，是csv格式，每行是一个样本，每列是一个位点。位点的取值是...
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基于的ssr 遗传多样性分析NOTE 基于种群聚类,特有等位基因 基本概念 1 多态性条带 个人理解就是ssr引物1 在位点 扩增出的 a b 2个条带（2倍体），ab长度可能相同也可能不相同。如果a条...
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生信、AI、大数据、育种。MiyuanBiotech
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蛋白质组学基础知识12-20
非生物专业小白一枚，因实验需要刚开始自学，不足之处烦请指正。在简书上也查阅了相关文章，如bioin前辈写的一些，受益匪浅，因此也将自己的整理分享出来，希望能帮助到有需要的伙伴...
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详解如何获取物种所有基因对应的GO注释
欢迎关注”生信修炼手册”! Gene Ontology是研究基因功能的重要数据库之一，在进行GO的富集分析时，需要提供所有基因对应的GO注释信息，本文介绍几种获取该信息的方式...
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R package：WGCNA加权基因共表达网络的构建与分析1.安装 载入WGCNA包时会发现部分包没有安装需要手动安装 打开多线程 2.导入数据 2.1 矩阵转置 2.2 查看 3 检查离群样本 4 选择合适的软阈值 sft为一个列...
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免疫学硕士一枚～<br>生信热爱者但是小白一枚~<br>目前成就为0~<br>加油哦，一大波成就正在路上啦~<br>啾~猪莎要加油哦~
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转录组分析5——差异表达分析差异表达分析内容：• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts，RPKM，FPKM，TPM➢ PCA图、热图等• 差异表达分析及可视化➢ limma-voom，edge...
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transcription factor转录因子介绍TF: transcription factor转录因子TFBS: transcription factor binding site转录因子结合位点TFBS是序列内的loc...
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请问ORF的长度是怎么找的呀
【生信】基因家族分析·学习组学大讲堂的笔记
本文所选文章： 1、基因识别与鉴定 S1：下载基因组蛋白质序列 S2：搜索结构域 Hmmer搜索PF00011，找到58个 从NCBI上下载是Hsp20基因的序列构成数据库，...
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【课程笔记】学CJ在腾讯课堂上的基因家族分析1明晰概念 基因是染色体上一段可以发生转录的区域 基因≠CDS 基因应该包括：CDS 内含子 UTR 启动子 可转录的区域是多变的 我们做分析的时候常用的是蛋白序列，而蛋白序列...
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基因家族分析策略
基本分析内容 数据库检索与成员鉴定 进化树构建 保守domain和motif分析 基因结构分析 转录组或荧光定量表达分析 数据库检索与成员鉴定 1. 数据库检索 一般在以下数...
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用TBtools，快速高效实现基因组共线性分析与可视化， 赞！写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
