请问GWAS CATLOG的数据也都是UKB的数据吗,我一直以为它是独立的数据库
孟德尔随机UKB和芬兰数据库的数据获取一般,孟德尔随机会用UKB的数据作为训练集,用芬兰的数据库作为验证集,如果想直接在R语言里面用在线的数据库的话,可以直接用IEU数据库(https://gwas.mrcieu...
请问GWAS CATLOG的数据也都是UKB的数据吗,我一直以为它是独立的数据库
孟德尔随机UKB和芬兰数据库的数据获取一般,孟德尔随机会用UKB的数据作为训练集,用芬兰的数据库作为验证集,如果想直接在R语言里面用在线的数据库的话,可以直接用IEU数据库(https://gwas.mrcieu...
老师,这套分析请问是否方便提供完整的分析思路,包括如何从那两篇临床试验提取概率矩阵等信息,想系统的学习下。
如何利用R语言进行卫生经济学的成本效果分析读者朋友你们好啊,如果你关注过之前几期公众号(全哥的学习生涯)的内容,你会知道我着重分享了如何利用R作meta分析的方法。而由于我本人研究方向的问题,今天这一期的内容将以文末...
Markov模型的结局是不是只能是分类变量,如果是连续变量的话该怎么进行成本效果分析呢
如何利用R语言进行卫生经济学的成本效果分析读者朋友你们好啊,如果你关注过之前几期公众号(全哥的学习生涯)的内容,你会知道我着重分享了如何利用R作meta分析的方法。而由于我本人研究方向的问题,今天这一期的内容将以文末...
你好,请问ICD相关基因和lncRNA的相关性分析博主知道是怎么做的吗,我看了下原文这一段没有说明,是先把ICD相关基因整合成一个风险分数吗?
基于免疫原性细胞死亡相关lncRNA模型,预测抗肿瘤药物靶点预后价值Prognostic value of antitumor drug targets prediction using integrated bioinformatic an...
另外想再请教一下,利用差异表达基因座fgsea的时候logFC>0和logFC<0的基因要分开分析吗
fgsea单细胞转录组GSEA富集分析Gene Set Enrichment Analysis(GSEA),Subramanian et al. 20051[https://doi.org/10.1073/pna...
请问下作者运行fgseaRes<- fgsea(fgsea_sets, stats = ranks, nperm = 1000)这一句的时候有没有报很多warning信息,我的虽然正常出结果了但是有3条waring
fgsea单细胞转录组GSEA富集分析Gene Set Enrichment Analysis(GSEA),Subramanian et al. 20051[https://doi.org/10.1073/pna...
请问下scenic可以用windows系统的R跑 吗,还是必须用服务器linux吗
单细胞转录调控网络分析工具(TF,motifs)-SCENIC相信很多专题应该已经讲过SCENIC的使用,这儿,针对我自己对SCENIC的学习使用,遇到的问题做一个详细的讲解说明,希望能对大家理解学习应用SCENIC起到一些帮助。 SC...
请问下scenic可以用windows系统的R跑 吗,还是必须用服务器linux的
SCENIC安装踩坑教程一、官方提供的安装方法 #详细的安装教程参考官网 https://github.com/aertslab/SCENIC 安装代码如下 在安装SCENIC之前,请按照以下代码安...
请问下scenic可以用windows系统的R跑 吗,还是必须用服务器linux
2019-08-28第七天:关于SCENIC的使用教程文章来源:scenic: single-cell regulatory network inference and clustering github 一、软件安装 安装教程...
您好,想咨询下新的热点之类如何去探索呢,感觉每次都落后一步
发生信SCI的希望不应该寄托在过去的热点上自从生信利用热点发SCI流行起来之后,现在各种各样的热点都被用来做生信了,只要有新热点出来,肯定会被用来做生信;只要该热点有一篇生信文章出来了,就会有越来越多人来模仿这篇文章...
cibersort可以自定义单细胞的基因集在tcga里预测吗,这个好,我一直在找单细胞聚类联系到bulk生存的方法
最近7.7分SCI,单细胞分析+WGCNA+实验验证,有实验条件者可轻易模仿,肿瘤非肿瘤均适合!发表杂志:Biological Procedures Online 影响因子:7.71 生信分析咨询 请关注“生信小课堂”全网同名 研究背景: 结直肠癌(CRC)是全球癌症相...
作者对单细胞测序了解的多吗,最近看到篇nature的单细胞过滤标准很奇怪,他测的CD3,然后对线粒体和核糖体的过滤策略竟然是线粒体小于10%,核糖体大于10%,我是第一次看到选核糖体大于10%而不是压低的
如何巧妙利用单细胞核糖体基因发NAR说在前面 相信很多小伙伴在分析单细胞数据做差异基因分析时都有这样的经历:发现往往差异最明显的都是那些什么RPL/RPS打头的核糖体基因。每当这时很多人的第一反应(小编也是这样...
请问presto和findallmarkers有啥异同吗,我看检验方法应该都是wilcox,有优劣之分吗
单细胞之富集分析-1:单细胞GSEA分析流程单细胞GSEA分析需要的文件有两个:1. 单细胞基因表达变化数据(两列,一列是geneid/gene symbol,一列是logFC)(文件格式:.rnk)2. 目标基因集(...