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  • 请问,多个属多个物种单拷贝同源基因建树时,保证每个单拷贝同源基因都至少60%样本比例,那串联时,样本里那些没有的基因怎么办?是直接“——————”代替吗?

    如何轻松构建物种系统发育树

    在常规的基因组分析中,当我们对某一物种的基因组进行从头组装与注释获得其的基本信息后,通常会想知道该物种与一些其他近源物种之间的进化关系,此时就需要构建不同物种之间的系统发育树...

  • 有没有人知道,KeyError: 'Unknown INFO field: ANN'
    这个bug怎么改啊
    我的vcf没有ANN啊
    CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT sample1 sample2 sample3 ……

    用snpEff产出的vcf提取4DTv位点,构建进化树

    用snpeff产出的vcf提取4DTv位点,用于构建进化树 转载自https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/1055...

  • 用conda来安装大部分python/R/JAVA的软件包

    昨天发现了神器multiqc来整合分析一个目录下所有文件的quality control结果,今天来试着装了一下。 然后又发现了conda这个使得生活更美好的package ...

  • 楼主,你好。
    我用自己的数据snp—甲基化数据做了 MatrixEQTL,生成的图 plot(me)很奇怪。不管是什么模型,都是梯形上升。不是对角线的…… 请问我这种是不是数据不是正态分布的原因?

    多组学联合分析-Matrix eQTL

    找到Matrix eQTL这个包,看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations(...