240 发简信
IP属地:浙江
  • 2020-02-10

    GSE125042+WGCNA 数据下载+预处理 数据可用,已经是log后的数据了 WGCNA log2FPKM 提取表达矩阵 筛选sft值 选...

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    2020-02-05

    GSE95070和GSE95426进行联合差异基因分析 下载两个小鼠的数据集,想对他进行联合差异基因分析。有两种思路,一是对各个数据集进行差异分...

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    数据上传到NCBI

    (不过上传数据真的网要好) https://www.jianshu.com/p/ea2cbf68a3ce https://www.jianshu...

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    2019-12-30 WCGNA 2.0

    数据准备 按照健明老师的公众号,进行数据准备 step2:确定最佳beta值 选择合适“软阀值(soft thresholding power)...

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    2019-12-28学习内容

    学习内容(WCGNA) 之前在GEO数据挖掘的时候出现了问题,所以就去跑了一遍,又熟悉了一下流程,刚好现在来学习一下TCGA 基本概念 WGCN...

  • 2019-12-24TCGA 2.0

    12/2学习内容(TCGA 2.0) 上午 继续阅读关于老师发的文献,不过这次老师发的文献感觉有点难理解了,需要一定的知识储备,所以阅读的时候不...

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    2019-12-23

    12/2学习内容(TCGA) 整理了之前的笔记,然后再操作一下关于TCGA的数据下载,刚好用上次老师完成的对24篇文献的处理进行处理,通过看了健...

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    2019-12-21

    12.21Wes -seq笔记总结1 上午 wes-seq 之前跑了rna-seq的上游总结了流程,现在想把上周的东西整合归纳一下,在跑一遍 软...

  • 2019-12-13

    数据标准化(中心化+均一化) Center,就是中心化。什么是中心化呢?the variables should be shifted to b...