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全面解析Kmeans聚类(Python)一、聚类简介 Clustering (聚类)是常见的unsupervised learning (无监督学习)方法，简单地说就是把相似的数据样本分到一组（簇），聚类的过程，我...
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单细胞108篇文献解读之7---Single-cell RNA sequencing highlights the role of inflammatory cancer-associated ...
单细胞分析揭示iCAF亚群在膀胱癌治疗中的靶标作用作者：biogevin审稿：童蒙编辑：amethyst 我们在前面已经介绍过膀胱细胞的相关背景（认识膀胱细胞——单细胞水平比...
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Seurat Weekly NO.11 ||预告2021 Single Cell Genomics Day在这里，和国际同行一起学习单细胞数据分析。 还记得2019年上的第一门比较完整和前沿的课程是Suerat团队的Single Cell Genomics Day，当时的议题有：...
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ReactomeGSA：高效的单细胞通路分析工具前情提要： SPATA：基因集驱动的空间转录组分析框架[https://www.jianshu.com/p/81ce67b27529]enrichplot||基因富集结果可视...
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北京博奥晶典生物技术有限公司（以下简称“博奥晶典”）是博奥生物集团有限公司暨生物芯片北京国家工程研究中心的产业化平台，是清华大学布局生命健康领域的核心企业。博奥晶典始终坚持自主创新和成果转化，立足新一代生物检测技术，拥有研发、生产、销售以及第三方独立医学检验所服务为一体的完整产业链；并响应国家关于”预防为主”的健康方针，将现代医学与中国传统医学紧密结合，打造出集健康产品、健康管理、医疗康复和大数据于一体的大健康产业版块。依托完善的生物技术平台，博奥晶典向国内外生命科学研究、医学检验、新药研发、健康管理、司法鉴定、农林畜牧和食品安全领域提供仪器设备、配套试剂耗材、科研服务外包、实验整体解决方案等，系列产品和服务已出口北美、欧洲、亚洲等30 多个国家和地区。<br>依托清华大学和博奥生物集团的技术实力，博奥晶典开发了系列用于遗传性疾病、感染性疾病、肿瘤、个体化用药、疾病易感基因检测等临床急需的分子检测类产品，以及健康检测、健康检测产品和调理品，为精准诊断、精准健康提供产品服务和整体解决方案。截止目前，已在北京、上海、重庆、河南、山东、山西、吉林、浙江、广东、新疆等四十余个省市地区开展遗传性耳聋基因检测、无创产前基因检测以及社区糖尿病健康管理公益项目筛查项目，数百万家庭因此受益。作为国内生命科学领域领军企业，博奥晶典始终秉持“致力技术创新，成就健康梦想”的理念，打造全生命周期、全方位的健康服务体系，创建适合中国国情的医疗健康服务新模式，以多元化的健康产品普惠民生，助力“健康中国”建设。
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dynamo||基于代谢标记的RNA速率测量工具
RNA velocity通过比较新的（未剪接的）和成熟的（剪接的）转录本的水平来推断基因表达的即时变化（La Manno et al.2018。尽管单细胞的RNA veloc...
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monocle 轨迹图改颜色我们在采用monocle做细胞拟时序分析的时候，常常会不满意于原图的配色，而软件自带的配色是根据降维后分出的cell type进行颜色的分类的 那么我们可以通过 来完成 参考...
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RNA速率：使用Seurat的结果做RNA velocity参考链接:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R[https://github.com/velocyto-team/veloc...
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【文献速递】-基于神经网络的迭代转移学习在单细胞RNA-seq分析中的聚类和细胞类型分类在单细胞RNA-seq (scRNA-seq)分析中，聚类和细胞类型分类是重要的步骤。随着越来越多的scRNA-seq数据可用，利用外部注释良好的源数据的监督细胞类型分类方法...
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PROGENy ||推断通路活性异常细胞信号会引起癌症等其他疾病，并且是常见的治疗的靶点。常可以通过基因的表达来推断某个信号通路的活性。然而，只考虑基因表达对通路的作用往往忽略了翻译后修饰的作用，并且下游信...
