发简信
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@曦曦1996 emmm抱歉太久没看过简书，这个问题我也不记得了，大概是没有解决，反正公司直接提供了原始的OTU表，我就直接用了
Qiime1-1.介绍
倒腾学习了一段时间的qiime1和qiime2，决定苦心整理一下学习成果。虽然不知道啥时候才能更完。主要参考下述网站的分析流程：https://twbattaglia.git...
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@赵会成 万分感谢，已毕业，早已解决
Beta多样性常用距离的区别
Bray-Curtis与Unifrac距离的区别：Unifrac考虑物种信息，计算依赖进化树文件 Weighted 和Unweighted Unifrac距离的区别：是否考虑...
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numpy.shape()和.shape
【参考资料】 https://blog.csdn.net/qq_28618765/article/details/78081959shape函数是numpy.core.fro...
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朴素贝叶斯(Naive Bayes)一. 生成式（generative）学习算法 如果算法直接学习，或者尝试学习从输入空间到类别的映射关系的算法，称为判别式（discriminative）学习算法；比线性回归（...
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【机器学习实战】02-决策树ID3
【博客的主要内容主要是自己的学习笔记，并结合个人的理解，供各位在学习过程中参考，若有疑问，欢迎提出；若有侵权，请告知博主删除，原创文章转载还请注明出处。】[TOC] 1.什么...
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2019-11-12【精华】P值校正方法小汇总转发自http://crickcollege.com/news/237.html 前言在以往的推文中，小编给大家整理了两篇有关假设检验的推文，其说明的主要问题是：1. 什么是...
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大佬，我在学习ecology-network，教程里用的psych::corr.test()，主要是有adjust的设置，但是我数据可能是十几万个，有点大，它跑死了。用Hmisc::rcorr()能跑出来，有没有能算r又能校正的函数啊……虽然我也不是很懂有没有必要adjust……
R使用笔记：相关系数:cor.test();corr.test();rcorr()
本次笔记内容：cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {spearmanCI} spea...
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Jupyter Notebook介绍、安装及使用教程
一、什么是Jupyter Notebook？ 1. 简介 Jupyter Notebook是基于网页的用于交互计算的应用程序。其可被应用于全过程计算：开发、文档编写、运行代码...
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关于annaconda导包pandas报错C extension的问题
自学pandas数据分析时，被安利annaconda ，因为它可以解决一些依赖关系，会省去不少的麻烦，但是安装之后，发现导包一直不成功。理论上pandas是annaconda...
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phyloseq包的使用
参考资料： https://www.yunbios.net/phyloseq.html https://joey711.github.io/phyloseq/import-d...
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机器学习基础（1）- ROC曲线理解本文用于理解ROC曲线的定义，绘制过程及其应用实现，主要用于自我温习回顾基础 基本目录如下： 什么是ROC曲线？1.1 ROC曲线的历史1.2 ROC曲线的定义1.3 ROC...
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最后没辙了，各种修改各种报错，我估计是OTU表格问题，手动提取了OTU-Simple这俩数据组成纯数值矩阵就正常工作了。
扩增子测序中OTU表进行抽平的两种方式
A random rarefaction of sample reads according to a specific reads length (usually the ...
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大佬，我照着跑colSum的时候报错Error in colSums(bac.otu) : 'x' must be numeric，这个怎么弄啊，我是小白。瞎弄了as.data.frame之类的没反应……
扩增子测序中OTU表进行抽平的两种方式
A random rarefaction of sample reads according to a specific reads length (usually the ...
