写在前面在进行基因组学研究中，总避免不了对一些SNP和Indel进行分析，如何去注释它们的，就需要用到SnpEff，SnpEff是一个变异注释和预测变异影响(氨基酸和核酸改变...
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【基因组学工具】变异注释SnpEff
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全基因组重测序基础及高级分析知识汇总
转自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因组重测序是通过对已有参考序列（...
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SnpEff结果解读SnpEff结果文件的解读 根据上一篇简书中SnpEff结果产生的4个文件进行解读 第一个文件：positive.snp.eff.vcf 其实positive.snp.eff...
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snpEff使用说明（上）-了解及创建SnpEff注释数据库SnpEff是一款注释变异位点（SNP+InDel+MNP）和预测变异对基因的影响（例如氨基酸变化）的工具。 用法： 输入文件：输入是变异位点（SNP，插入，缺失和MNP）的...
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TBtools | 开箱须知写在前面 最近可能是不少人要赶毕业论文，于是找上了 TBtools，并急急忙忙希望解决自己的问题。于是，他们总是会在群里 @我 或者 @管理员。事实上，这是一个违背群约定的事...
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【动物学笔记】多孔动物门
多孔动物门（Phylum Porifera) 也叫海绵动物门，体型多数不对称，海绵体表有无数小孔，是水流入体内的孔道，与体内管道相通，然后从水孔排出。群体海绵有许多出入水孔。...
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TBtools | 地球最友好的 GFF3/GTF 序列提取工具无论是Windows，MacOS, Linux桌面的用户，你都可以也会使用。 写在前面 伴随基因组测序的普及，越来越多物种的基因组测序项目开展并报道，为科研工作者提供了更为全...
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常用生物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3、bed、sam、bam、vcf)前言 在各个行业都是有行业标准的，这样才能统一规范而方便后面的分析，在生物信息学领域中主要是各种大量序列数据、注释数据等，这些都是有特定的格式去表示，下面列举几种常见的格式。...
