怎么网上都是这一个帖子
基于orthofinder 结果构建物种树串联法 orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列，可以直接使用。找到orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列，SpeciesTreeAlignme...
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为什么我的没有continue mapping
用cytoscape画网络图
经常看到文章中有那种好漂亮的网络图，偶也想自己画一个呢，但是不会咋整呢？ 别急，今天本椒就分享一下用cytoscape画互作网络图！ 看一遍就会啦。。。还不会！那就多看几遍哈...
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正负相关怎么用线条颜色设置
用cytoscape画网络图
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非常详细的一篇教程了
用cytoscape画网络图
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@GPZ_Lab 我也想知道怎么导出结果
R使用笔记：相关系数:cor.test();corr.test();rcorr()
本次笔记内容：cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {spearmanCI} spea...
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@小潤澤 啊…不是。我从数据库下载数据，它有contig scaffold complete水平。
为什么contig不组装到complete水平。
是组装不到，还是人没有组装基因组组装和注释理论
基因组组装 1.k-mer 那么我们首先要看一下k-mer是什么。它的定义是：是指将一条序列分成包含k个碱基的子字符串，如果reads长度为L，k-mer长度设为k，则产生的...
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@小潤澤 为什么会有coting scaffold complete组装水平，为什么不都组装到complete.是人为没有组装到complete水平，还是它序列本身组装到complete水平
基因组组装和注释理论
基因组组装 1.k-mer 那么我们首先要看一下k-mer是什么。它的定义是：是指将一条序列分成包含k个碱基的子字符串，如果reads长度为L，k-mer长度设为k，则产生的...
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序列组装水平，会影响注释结果吗？
宏基因组分箱（六）Prokka基因预测，注释COG、EC、RNA
导读 prokka注释细菌基因组，获得该基因组的CDS、Gene、RNA、EC、COG等注释信息。 一、基本信息 文章：Prokka: rapid prokaryotic g...
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基因组装水平会影响注释结果吗
「生信软件」好用的细菌基因组组装与注释软件
1. Spades[https://github.com/ablab/spades] 细菌基因组组装最佳软件(主观感受)，可进行二代组装，三代组装以及二代三代混合组装。 2...
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想问组装水平会影响KEGG注释结果呢
基因组组装和注释理论
基因组组装 1.k-mer 那么我们首先要看一下k-mer是什么。它的定义是：是指将一条序列分成包含k个碱基的子字符串，如果reads长度为L，k-mer长度设为k，则产生的...
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救命！！为什么输出了四个空文档
零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM...
写在前面 早前已经推过《新手eggNOG-Mapper详细教程》，但仍然有很多人遇到使用问题。换句话，可能那个教程不能彻底解决大伙遇到的问题。于是我决定写一个完美的教程，彻底...
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如果是要.faa格式的 是不是 -faa
autoprokka:使用prokka批量注释
autoprokka.py这个Python脚本可以方便地批量地使用prokka去进行注释，自动按照输入文件名去命名输出文件，并且每个样本单独一个文件夹存放注释后结果，.gff...
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