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实验记录13: scanpy细胞分化轨迹推断大型真香现场与上次翻车实验的不同: 过滤了更多的细胞和基因。在处理数据时,低质量的细胞一定要清除掉,告诫大家宁缺毋滥。。。否则后续分析真的是一堆的噪点。 跳过了scanpy中的降噪步骤。...
写的连载太棒啦,获益匪浅 ,想问下注释细胞类型的具体过程吗?比如是不是选取每个cluster的前几位marker gene,然后每个marker gene都去搜文献看是对应什么细胞类型?能不能分享下具体的步骤呢?
实验记录13: scanpy细胞分化轨迹推断大型真香现场与上次翻车实验的不同: 过滤了更多的细胞和基因。在处理数据时,低质量的细胞一定要清除掉,告诫大家宁缺毋滥。。。否则后续分析真的是一堆的噪点。 跳过了scanpy中的降噪步骤。...
与上次翻车实验的不同: 过滤了更多的细胞和基因。在处理数据时,低质量的细胞一定要清除掉,告诫大家宁缺毋滥。。。否则后续分析真的是一堆的噪点。 跳过了scanpy中的降噪步骤。...