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4. 漂变与物种内的遗传多样性碎碎念：这一小节极其硬核，除了一上来就放一些语焉不详的公式计算，还有一些关键概念和上一节解释不同。。。我估计得多读几遍/查查其他资料才能了解在说什么。这段翻译就先按照原文来。...
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群体遗传学统计指标——种群核苷酸多样性理论 种群核苷酸多样性，顾名思义指的就是核苷酸多样性，值越大说明核苷酸多样性越高。通常用于衡量群体内的核苷酸多样性，也可以用来推演进化关系。计算公式为： 计算群体的π值，可以...
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农民的儿子
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MEGA序列转换位点与颠换位点统计2020-11-25使用MEGA进行序列转换位点与颠换位点统计 1准备fas数据 换成mega格式 要进行序列统计分析需要meg格式的文件。我用如下方法进行转换： 1-先导入fas序列选择ali...
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收录比较基因组学，进化基因组学，群体基因组学，分子进化，及相关领域的各类文章。特别地。由于是简书，建树的内容当然是必不可少了。 欢迎大家投稿
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IQ-TREE的使用 - 超快速用极大似然法构建进化树
写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是，常用的快速构建ML树的软件是FastTree，如果要求准确，我会在服务器上使用RaxM...
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用MrBayes构建系统发育树操作步骤整理总结
最近在学习构建进化树，尝试了用PHYML构建ML树和用MrBayes构建贝叶斯树，因为构建ML树时用的是网站的PHYML进行的，操作简便，所以就未做整理，只详细整理了一下贝叶...
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