基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...
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如何对基因组序列进行注释 -
Augustus 基因从头预测
目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论，通过已有物种的注释信息对软件进行训练，从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构，在这方面做的最好的工具是AU...
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syri-基因组sv检测及可视化软件SyRI（Synteny and Rearrangement Identifier），是一款用于基因组结构变异检测及可视化的软件。SyRI首先查找重排区域，然后搜索序列中的差...
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ResNet-RS：谷歌领衔调优ResNet，性能全面超越EfficientNet系列 | 2021 arxiv论文重新审视了ResNet的结构、训练方法以及缩放策略，提出了性能全面超越EfficientNet的ResNet-RS系列。从实验效果来看性能提升挺高的，值得参考 来源：晓飞...
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从 R-CNN 到 Mask R-CNNR-CNN 在那个时间点，基于深度学习的卷积神经网络开始屠榜ImageNet，R-CNN的思路非常直接，既然在图像分类方向上卷积神经网络效果这么好，那么如果把一张图的所有目标...
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高光谱遥感图像相关知识梳理大全前言 本资料整理了高光谱遥感图像概念定义、分析处理与分类识别的基本知识。第一部分介绍高光谱图像的一般性原理和知识，第二部分介绍了高光谱图像的噪声问题；第三部分介绍高光...
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Keras复现VGG16及实现花卉分类VGG网络 VGG网络是2014年ILSVRC竞赛的第二名(第一名是GoogleNet，即后来的inception)，由牛津大学的计算机视觉实验组提出。原始论文地址https...
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ResNet笔记整理目录 Resnet 1.01.1 Resnet1.0原理1.2 Residual Learning1.3 Resnet实践细节 Resnet 2.02.1 改进2.2 Ide...
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Pytorch学习记录-使用Pytorch进行深度学习，使用案例学习Pytorch注意确定已经安装了torch和torchvision使用案例学习Pytorch在完成60分钟入门之后，接下来有六节tutorials和五节关于文本处理的tutorials。争...
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使用python对高光谱数据进行处理和分类目的 加载遥感图像的.mat数据进行呈图显示 将.mat的数据转化为python后续算法处理的csv文件 存储训练模型，观察分类效果，在图中显示与原图对比 方法 Refer：...
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三代比对软件-ngmlr软件名：ngmlr 版本号：ngmlr 0.2.6 1. 软件用途综述 NextGenMap-LR(ngmlr)主要用于三代测序的长reads（PacBio 、Oxford ...
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DEseq2 均一化多个处理的样本
我要做一个分析，需要用均一化的数据，学生说之前是需要两两去做DEseq2，然后再做下游分析，我觉得太麻烦。于是摸索了下，DEseq2可以均一化多个样本。代码如下：我这里是8个...
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TRF--Tandem Repeat FinderTRF软件是基因组注释中常用于检测序列中串联重复序列的软件，无需安装，使用简单方便。 1. 重复序列分为串联重复序列和散在重复序列（转座子）； 串联重复序列又包含卫星序列 >...
