总结(看的有限): 1. 大部分方法为基于深度(划分区间检测)的方法(FPKM、区域碱基数的类似FPKM算法)。 2.大部分软件会使用对照样本作为reference作为基线,...
今天分享一个接纯生信又接收SEER数据挖掘的期刊,这个期刊就是Bosnian Journal of Basic Medical Sciences,简称BJBMS,影响因子:2...
杂志概要 今天要介绍的期刊是cancer immunology research,创刊于2013年,同Clinical Cancer Research、Cancer Rese...
SEER数据的大规模数据优势是无可比拟的。大规模的病例数还可以减轻病理学诊断的少数或随机错误分类的影响。SEER依靠实验室的质量规范来最大程度地减少此类错误 肿瘤发病率的研究...
SEER数据库介绍 基本介绍:SEER数据库全名(Surveillance, Epidemiology, and End Results ),是美国权威的癌症统计数据库,该数...
四种方法,可以新增数据列 直接赋值 df.apply方法 df.assign方法 按条件选择分组分别赋值 1、直接赋值 注意,df["bWendu"]其实是一个Series,...
通过Pandas库可以从多种格式的数据文件中读取数据,也可以将处理后的数据写入到这些文件中。pandas库中的pd.read_excel()相较之前的xlrd库的读表操作更加...
在上一篇文章《GEO数据挖掘:(一)寻找共同差异基因》中我们通过两个实验的数据寻找到了一些差异基因,本篇文章将对这些差异基因的互作关系进行简单的分析,用到的工具主要有Stri...
前言 通常,在识别完了差异基因之后,都会对差异基因进行功能富集,来获取差异基因参与的潜在生物学功能通路或生物学进程,有助于理解基因之间的作用关系以及发现基因在癌症发生发展过程...
拿到一串感兴趣的基因,它们究竟参与那些生物学功能,是否与预期相符?最简单的解释办法是通路富集分析(pathway enrichment anlysis)。通路富集分析的基本步...