关于WGCNA的分析,共有3期教程,今天是的第三期。前面两期是使用代码进行分析的,也是我们的平时最常用的分析方法,对我个人来说也是最简洁的方法。(PS:对于使用代码分析,个人...
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1、Cibersort.R2、LM22.txt3、genes_exp.txt 1、Cibersort.R 此文件为源代码,在使用之前请阅读一下代码中的注释段,安装一下前置包在...
亚细胞定位是指某种蛋白或某个基因表达产物在细胞内的具体存在部位,包括细胞核、细胞质和细胞膜等部位。传统的实验方法有,利用一些荧光蛋白如GFP、YFP,通过其在激光照射下发出的...
网站链接[https://public.bigomics.ch/app/omicsplayground_contrib] Omics Playground是一个免费的生信分析...
1.数据标准化 (1)标准化 (2)样本总体分布 (3)样本之间的相关性 2.差异表达分析 (1)limma包分析 (2)edgeR分析 (3)DESeq2分析 3.差异结果可视化
数据下载:不要下载raw data细胞系注释文件: Cell-line-annotation[ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/project/cance...
hello大家好,小月亮又和大家见面了。上篇软文小月亮给大家介绍了NetworkAnalyst3.0工具的概览。这次小月亮就给大家详细介绍NetworkAnalyst3.0工...
一、前言 前段时间主管让我在GEO数据库弄个表达图谱,准备接下来做各种转录组分析,现在回过头来,觉得这个东西比较简单,十分适合上手练习。思考了一下,决定写下来分享给大家。注意...
分子实验的常规检测内容除了基因就是蛋白啦,ELISA、WB、免疫组化...理论知识很扎实,可是实验结果却很扎心,比如WB,条带总是那么不正常,要么没有,要么弥散,要么非特异。...
你好,请问一下seurat包读取文件总是出错可以解答一下嘛
【单细胞转录组 实战】九、复现文章数据——Seurat Package这里是佳奥!单细胞转录组的学习并不轻松,进度过半让我们继续吧。 1 再次了解文章数据 2 使用Seurat Package(新版参考文档修改) 新版代码参考: 同样的发现,普...
前面小编给大家分享了几个科研中经常用到的基因集,以及如何使用这些基因集进行相关分析。 ☞ m6A甲基化相关基因集[https://link.zhihu.com/?target...
这里是佳奥!我们继续学习最重要的三个R包。 1 scater Package(calculateQCMetrics已停用,用addPerCellQC替代) 加载R包 创建测试...