100天生信-Day4 最近在做类ChIP-seq，看了一下使用ChIPseeker注释peaks的方法，保存一下代码： 参考教程：https://www.jieandze1...
发简信
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ChIP-seq之ChIPseeker注释peaks
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CHIPseq流程1. 环境配置 2. 数据下载 (1)prefetch下载 首先找到要下载的数据（SRR...号）创建project文件夹 利用chipseq环境中prefetch 软件进行...
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blast 用法汇总blast 安装： 先在网上找到最新版的blast下载到本地；this is the download padge: ftp://ftp.ncbi.nih.gov/bl...
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独立开发者，终身学习者，喜欢交朋友，欢迎讨论，共同成长，一起进步。
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这或许是我写的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
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blastn的用法
方法参考：https://blog.csdn.net/likelet/article/details/7567426http://blog.sciencenet.cn/blo...
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暂别简书，后会有期
我不是老师，也不是大神，更不是前辈。我只是个普通的科研工作者，一个只想努力变得更好的人。 来到简书快3年了，期间写了不少的笔记。很多的笔记是在疫情严重时wfh的时候写的。至今...
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ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：https://www.jianshu.com/p/8aca72809c5c） 组蛋白修饰能预测染色质的类型（异...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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Rose软件寻找超级增强子
（1）这个前提是已经用Macs2寻找到了peaks, 很多人可能不明白一些人写的怎么将bed文件转化为.gff文件，其实根本不用，我们直接将Name_peaks.narrow...
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@寒山梦琦 你会rose吗能交流一下吗拜托拜托
super-enhancer神器ROSE的使用
ROSE是大名鼎鼎的Richard A.Young实验室开发的，全称是RANK ORDERING OF SUPER ENHANCERS，用来找增强子和超级增强子。 ROSE安...
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@寒山梦琦 我不知道homer能做超级增强子😥还是谢谢你
super-enhancer神器ROSE的使用
ROSE是大名鼎鼎的Richard A.Young实验室开发的，全称是RANK ORDERING OF SUPER ENHANCERS，用来找增强子和超级增强子。 ROSE安...
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楼主请问rose能用于除了人和小鼠以外的物种吗
ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)
在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：https://www.jianshu.com/p/8aca72809c5c） 组蛋白修饰能预测染色质的类型（异...
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请问rose能用于除小鼠和人之外的物种吗
Rose软件寻找超级增强子
（1）这个前提是已经用Macs2寻找到了peaks, 很多人可能不明白一些人写的怎么将bed文件转化为.gff文件，其实根本不用，我们直接将Name_peaks.narrow...
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请问解决了吗，我也有这个困惑😭
super-enhancer神器ROSE的使用
ROSE是大名鼎鼎的Richard A.Young实验室开发的，全称是RANK ORDERING OF SUPER ENHANCERS，用来找增强子和超级增强子。 ROSE安...
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杂七杂八和学习记录。。。
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【科研】本地Blast安装与使用（Win）
一、软件下载与安装设置 1、进入网站，根据电脑系统选择相应最新版本[ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/L...
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连锁不平衡（LD）分析。在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是非常常见的内容，同时也是关联分析的基础。在很多的遗传进化GWAS的文章中都会出现LD衰减或者block单倍型块的图。那么什么是连锁不平...
