如何用MEGA-X构建进化树_生物研究_实用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]...
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MEGA构建进化树 -
基因、蛋白等的命名本文介绍了基因、蛋白、引物、载体、限制酶切位点、酶、微生物的命名规则。由于涉及领域宏大，全面的细则以报告或文件的形式发表，本文只是对各类的命名做形而上的简介，同时融合了笔者的...
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把1M图片优化到100kb的家伙，就是我！坦白从宽吧，我就是那个花了两天两夜把 1M 图片优化到 100kb 的家伙——王小二！ 自从因为一篇报道登上热搜后，我差点抑郁，每天要靠 50 片安眠药才能入睡。 网络上曝光...
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站在巨人的肩膀看世界
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在线绘制聚类热图（heatmapper）
在线绘制聚类热图 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/9d26bd8cd539?utm_campaign=haruki&...
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任何人！十分钟掌握Circos图绘制
写在写在前面的前面 我不喜欢调用外部程序，如果是简单的事情。我觉得应该用最简单的方式来实现。如果你只是想画一个简单的Circos图，perl？不用的。R？不用的。网页？不用的...
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可视化！Circos 图绘制，更简单更灵活更方便~写在前面 为什么 TBtools 用起来舒服，相比于不少其他软件，同质非同质的？我想了很久，可能原因之一，即“开发者即用户本身”，简单来说，“我写的软件是就是给自己用的”，而...
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本地化的NCBI BLAST+的安装及使用
在生物信息学，BLAST(基本的局部比对搜索工具)是一种算法，用于比较生物的序列信息，诸如蛋白质的氨基酸序列、DNA或RNA核苷酸序列。BLAST搜索使研究人员能够将一个目标...
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本地化BLAST+进行目标序列比对举个栗子🌰： 最近对拟南芥中的一个叫做CBF的基因非常感兴趣，现在我想看看这个CBF基因在一个新测序的物种Am基因组上是否存在，Am中有几个CBF基因？这样的查找可以通过本地...
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TBtools:基因家族分析简单流程写在前面：非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具。作者（CJchen-0410）在B站上有新手教程，大家可以给大神点个关注。 本文以《Genome-wide iden...
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差异共表达网络-Co-expression networks写在前面，这篇文章主要整理自于Gene co-expression analysis for functional classification and gene–disea...
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使用limma、Glimma和edgeR对RNA-seq数据分析笔记1 摘要 简单且高效地分析RNA测序数据的能力正是Bioconductor的核心优势之一。在获得RNA-seq基因表达矩阵后，通常需要对数据进行预处理、探索性数据分析、差异表...
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批量设计qPCR引物，可最大限度满足qPCR引物设计的黄金法则森言森语 眼看着十一月又到中旬，时间是过得真快。一个多月没怎么写东西了，实际上是有些懒。 这不马上就要开题论证了，听说定量是最受学生喜爱的实验了。 于是我也准备赶在开题之前在...
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什么，热图工具还能快速进行进化树节点分类可视化？写在前面 昨天中午，大湿兄（即你家Y叔）在他的个人公众号上推了一波ggtree的操作姿势，详细可见《多个热图，多种配色，还要分开画图例？》，具体见链接 https://mp....
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完全掌握TBtools热图绘制的使用细节（我就是要赚你的钱）前几天推出一个热图的简单介绍，基本上，应该是绝对的，所有人，用了TBtools，都可以输出一张热图，比如这样 但是有时候，我们需要调整很多东西，比如这样 更或者这样 那么怎么...
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bioinformatics
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五分钟看完：怎样不读文献而快速找到值得研究的基因？生物医学研究中总免不了对单基因或是某基因家族的分析，这样“优秀”的基因需要在疾病表达、临床病理特征、以及其他生物层面具有显著的意义，如免疫相关、浸润差异、突变差异等等，同时具...
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