数据准备GeneCount文件包含了所有同源基因组数目不为1的所有基因组，在各个样本中的数目；UnassignedGenes文件则包含了仅包含一个基因的同源基因组的样本来源信...
发简信
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orthofinder分析泛基因组及可视化 -
基于Roary构建泛基因组记录安装软件 创建环境 运行 NCBI下载{genome}.gbff格式的测试数据 gbff转gff格式 生成泛基因组 DeBUG !!!运行中如果有关于Perl脚本的报错，例如...
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@路人里的路人 好的，谢谢老师，他在orthofinder这一步就会给你推荐一个物种，然后我把他作为外群就可以正常运行了
使用orthofinder查找单拷贝基因并建树
本文主要是对这篇文章利用orthofinder寻找单拷贝基因构建系统发育树 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/52c2...
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老师，到第6步都照做了，第7步提示-o sepcific_species没有用来作为外群的物种啊？
使用orthofinder查找单拷贝基因并建树
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使用orthofinder查找单拷贝基因并建树
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利用orthofinder寻找单拷贝基因构建系统发育树新的系列系列教程[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]已上传，大家可以去看新的教程 1.orthofinder介绍 OrthoFin...
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看不懂了老师😭构建泛基因组这步用了哪些文件啊？（psvcp_v1.01-main/1Genome_construct_Pangenome.py；genome_gff_dir_example ;genome_list）这三个都是啥啊。而且只用python命令就行了嘛？
泛基因组Psvcp测试
环境 测试 1构建泛基因组 2 reads比对到泛基因组
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看迷糊了，先收藏了，常看常新
DNA链方向上的小疑惑
虽然是做生物信息的，但是经常被一些基础性概念所困扰……而我又是一个强迫症，于是把这些乱七八糟的东西整理了一下，强行写了一篇小文章。东西太杂，但是彼此相关，实在想不到什么合适的...
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DNA链方向上的小疑惑
虽然是做生物信息的，但是经常被一些基础性概念所困扰……而我又是一个强迫症，于是把这些乱七八糟的东西整理了一下，强行写了一篇小文章。东西太杂，但是彼此相关，实在想不到什么合适的...
