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小技巧3-直接提取作图数据（ggplot2）使用ggplot2作图时，尤其是箱线图时，我们都是直接使用的原始数据，而最终图中呈现出了最大值、最小值、中位数之类的数值，这些是由ggplot2内置函数自动计算得来的。 那如...
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2020-08-24质粒构建设计引物 引物长度一般在15~30 bp，最常用的是18~27bp； 引物GC含量在40%~60%之间，Tm值最好在72℃左右。Tm值简单粗暴的计算方法为Tm=4×(G+C)...
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表达质粒构建之引物设计比如我现在需要表达FUS这个蛋白，首先我要确定FUS的CDS区序列，使用NCBI即可获得； 可以看出FUS有三个同源异构体，我们以第一个X1为例来说明； 这是其CDS区序列信...
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GEO数据库挖掘—生信技能树B站视频以下是B站生信技能树GEO数据库挖掘的课程笔记 主要内容及学习目的： 介绍GEO数据库：了解数据存放位置； 介绍GSE项目的3种下载方式； 介绍ID转换：使用R语言技巧实现基...
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记录自己学习python的点点滴滴轨迹，希望以后回来看这个专题的时候，自己能有了更大的进步ヾ(●´∇｀●)ﾉ哇～
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LncRNA的shRNA慢病毒载体引物设计shRNA：小发卡或短发卡RNA(a small hairpin RNA or short hairpin RNA，shRNA)是一段具有紧密发卡环(tight hairpi...
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shRNA慢病毒载体合成步骤
要进行shRNA载体构建，首先需要根据自己的基因，设计出对应的靶点、loop序列，酶切位点序列，详见LncRNA的shRNA慢病毒载体引物设计 - 简书[https://ww...
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CRISPR-Cas9基因编辑5--不可或缺的sgRNA活性预实验前言： 大家都知道CRISPR-Cas9有脱靶效应，并且每个sgRNA的效率都不一样的，因此在做正式实验之前，我们要验证sgRNA的效率，之后优中选优。还是那句话，同样的目的...
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CRISPR-Cas9基因编辑1--背景介绍及gRNA设计（上）简介和前期文章 我对之前的所有教程进行了再次详细的总结 前言： 每当我们接触新事物时，都忍不住问如下图所示之哲学三问（当然有时候问的是，这是什么？可以吃吗？怎么做？）： 由于...
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SgRNA and lentiCRISPRv2SgRNA设计 目的基因SgRNA如何设计以及载体构建 简单目的SgRNA设计 目前SgRNA设计网站较多，张锋实验室总结了一下SgRNA设计工具https://zlab.b...
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GEO数据挖掘学习笔记一
全部流程来自：GEO数据库挖掘—生信技能树B站视频，建议去看原文！ 第一步：找到相关的GEO数据集（文献/搜索），以胃癌gastric cancer为例 可去文献中查找，用于...
