首先，一般我们分析水稻的数据时候，选用的是MSU和RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件，这里只介绍MSU的ID，RAPDB的同理。 水稻GO分析的网站很多（这里不...
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水稻GO和KEGG分析 -
【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小结
前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了，网红教授宣传得很成功，功能也比较强大，主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。简单总结下用法，以后用时可直接找...
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2021-03-12 水稻蛋白组学坎坷
蛋白组学的思路——之前时公司做的，已经分析过了，我只是尝试自己做一下。 1、得到蛋白原始数据，raw 2、搜库，用各种软件，自己体会的时MaxQuant，但是还没这个水平，最...
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转录组文章 | 2022《Journal of Hazardous Materials》细胞壁多糖在水稻钒解毒中的作用及其转录组机制一、导读 细胞壁多糖在重金属结合方面起着至关重要的作用，这有助于植物体内重金属的解毒。然而，目前有关于钒（V）与植物根系细胞壁结合的分子机制的研究目前还没有，尤其是有关于对水...
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使用MapMan分析水稻基因功能
MapMan是老牌的植物基因功能分析工具，早期是针对基因芯片数据设计，现在可以用于各种模式植物或非模式植物基因集的功能分析，并且该软件一直保持着更新。 完成MapMan分析，...
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Smart is the new Sexy
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激光共聚焦显微镜学习
荧光（fluorescence）的定义： 当某种常温物质经某种波长的入射光（通常是紫外线或X射线）照射，吸收光能进入激发态，立即退激发并发出比入射光波长长的出射光（通常波长在...
