测序数据比对结果 BAM 文件用 samtools 进行 sort 之后发现体积变小了...当时怀疑是不是 sort 过程中有一部分 reads 被丢弃了？于是统计了一下原始...
IP属地：台湾
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为什么 BAM 文件 sort 之后体积会变小
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SAM/BAM相关的进阶知识目录 samtools和picard的排序问题SAM文件中FLAG值的理解SAM文件中那些未比对的reads为什么一条read会有多条比对记录？同一份BAM文件samtool...
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Bismark（0.22.3）使用记录文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://github.com/FelixKrueger/Bismark[https://github...
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Data Analysis for the Life Sciences with R
介绍 在20世纪下半叶，数字技术的前所未有的进步产生了一个转变科学的衡量革命。在生命科学中，数据分析现在是几乎每个研究项目的一部分。基因组学，特别是，正在由新的测量技术驱动，...
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理解SAM文件格式以及过滤sam文件RNA-seq或者ChIP-seq等等测序的上游分析流程里的比对步骤相信大家都知道，我之前也只是按照各种教程去走流程，并没有仔细的研究过每一步的内容。今天这篇文章学习一下sa...
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NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...
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遗传学 博士研究生在读
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博主讲的太好了！！！！！！！！！！！！！！
seurat-NormalizeData()源码解析
年底复盘，发现很多知识点理解并不深入，想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响，我们需要对单细胞counts矩...
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seurat-NormalizeData()源码解析年底复盘，发现很多知识点理解并不深入，想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响，我们需要对单细胞counts矩...
