加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出
发简信
IP属地：山西
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@喂鸡组的阿翔 ⊙∀⊙，谢谢告知👍
使用SCENIC分析singlecell-RNAseq实战演练
SCENIC全称：Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering实战之前需要准备的学习资料：1.阅读关于SCE...
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就是下载的feather放的文件夹。dbDir =存放的路径就可以。作者提前设置路径了
R包SCENIC：分析流程
GRN：基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点; 过滤表达矩阵并运行R包GENIE3/GRNBoost...
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就是下载的feather放的文件夹。dbDir =存放的路径就可以
R包SCENIC：分析流程
GRN：基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点; 过滤表达矩阵并运行R包GENIE3/GRNBoost...
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请问解决了吗？我也遇到这个问题了
R包SCENIC：分析流程
GRN：基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点; 过滤表达矩阵并运行R包GENIE3/GRNBoost...
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骨科PhD🥼，生物信息🆕，摇滚乐🎸，啤酒🍺，滑雪🏂，喂鸡组成员👾
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2019-06-27 scenic: single-cell regulatory network inference and clustering
title：scenic: single-cell regulatory network inference and clustering journal：Nature me...
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GEO怎么提取样本信息呢？用的R
使用SCENIC分析singlecell-RNAseq实战演练
SCENIC全称：Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering实战之前需要准备的学习资料：1.阅读关于SCE...
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R包SCENIC：分析流程
GRN：基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点; 过滤表达矩阵并运行R包GENIE3/GRNBoost...
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R包SCENIC:安装
SCENIC:Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering 目前支持分析的物种：人、鼠、果蝇 input的要...
