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TCGA数据挖掘九：lasso回归加载表达矩阵和生存数据 进行lasso回归，找到最佳建模位置 再用得到的最佳的位置去建模 判断预测结果的准确性 后面这段是补充，可以不用看了。。。 最后 感谢jimmy的生信...
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R语言~高级PCA分析主成分分析，不只需要找到几个虚拟但不知具体为何物的主成分因子，还需要知道我们提供的变量在各个主成分因子上的载荷（有正有负）和贡献度，以及具体保留多少个主成分因子才能既尽量保留...
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CBNplot：将富集分析结果和临床特征相关联说在前面 生信宝库在之前的两期推文：CBNplot：可视化富集通路中基因的调控关系[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1...
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【单细胞高级绘图】07.KEGG富集结果展示这一节画的图是比较新的，图中我用红色箭头标出的是pathway 注释信息(big annotation，自己想的，非专有名词)，纵轴花花绿绿的标注是pathway的 注释(s...
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单细胞分析之细胞交互-5：NicheNet多组间互作比较常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...
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HRD 同源重组缺陷 基因检测产品研发同源重组缺陷，具体概念自己去搜，不想重复。仅以此篇记录下我这个因架构调整被砍掉的项目（做了这么多年肿瘤相关的产品开发，我要做点别的方向啦~做肿瘤做累了），希望能帮助到同样在开...
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fastq、fasta、bed、gtf、gff、sam、bam生信分析常见文件格式查看生信分析过程中的文件格式：除了原始测序数据fastq、fasta之外，还有基因组文件fasta格式，基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如bed、...
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DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap绘制带特定基因的单细胞热图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
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使用ggplot2优化Seurat绘图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] Seurat是分析单细胞数据一个非常好用的包，自带...
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正则表达式神器，以后再也不用百度了当有项目需求用到正则表达式，你会怎么做？打开百度直接搜索「手机号正则表达式」，复制到 IDE 运行一下看一看符不符合自己的期望？ 是不是常常因为找不到合适的表达式，深恶痛绝。...
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