关于基因组组装的流程可以参考我的简书:https://www.jianshu.com/p/e02ecd537c83 前面介绍了SOAPdenovo2的使用，但是由于结果整体不...
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基因组组装----SPAdes(一)
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相分离——目标蛋白引物设计（OE plasmid的构建）瞬转目标蛋白DNA，使其在细胞中瞬时高表达，在荧光显微镜下观察是否会形成聚合物颗粒。 1 蛋白表达质粒构建 （1）将自己的目标蛋白们的CDS区的DNA序列导入primer 5...
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pymol：使用脚本对蛋白互作结合分析图（蛋白--蛋白对接）在我们进行化学信息学相关的研究时，通过Autodock、schrodinger、Discover studio、MOE、ZDOCK等CADD软件进行蛋白蛋白互作时，通常需要对...
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第6章：抗体多样性2021-04-17导读 人体似乎能够产生无限量的抗体(免疫球蛋白[Ig])分子-也许宇宙中的每个抗原至少有一个！计算表明，人类抗体库中可能有多达10^11种不同的抗体分子可用，这些抗体具有不同...
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SWISS-MODEL蛋白模板和建模一个获取蛋白模板和建模的方法：SWISS-MODEL 官网：https://swissmodel.expasy.org/[https://swissmodel.expasy....
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使用alphafold2探索Covid19-Δ毒株新药作用靶点的研究Covid19-delta毒株引起的疫情搞得大家人心惶惶，作为一名科学研究人员，自然希望为疫情的控制尽一份力。写这篇帖子是为了将最新开发的alphafold2和Covid19...
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人工智能AlphaFold预测2.14亿蛋白结构蛋白质是生命的基石，由氨基酸链组成，并折叠成复杂的形状。由于蛋白质的形状与其功能密切相关，因此，了解蛋白质的结构可以更好地了解其作用和工作原理，这也是解决许多生命科学问题的关...
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推荐文章：https://www.jianshu.com/p/5af9293297ea ------------------------------------------------------------ 视编程为爱好，欢迎各类充满热情的编程技术分享。Python、C/C++、Java、Spring、.Net Framework、嵌入式、机电一体化所有和编程相关的内容都欢迎。 知识星球：https://t.zsxq.com/2ZfeAMN 公众号：亖的 side4u 企鹅群：470100934 点击链接加入群聊【编程直播室】：https://jq.qq.com/?_wv=1027&k=5w1pJpY
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核小体和组蛋白修饰的作用B站视频：复习：生化——核酸（1） - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/103809301] 核小体：真核生物DNA以...
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基于免疫原性细胞死亡基因进行肿瘤分型，发表8+纯生信。文章蹭上热点就可以事半功倍！生信小课堂 影响因子：8.786 本文属于单肿瘤分型思路，类似的分型文章我们也解读过很多。 肿瘤分型文章比较重要的结论就是分型后构建的评分能够预测免疫治疗或者其他治疗的疗效。...
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细胞系cell line相关数据库CLO（Cell Line Ontology） http://www.clo-ontology.org/index.php[http://www.clo-ontology.o...
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Meta分析软件盘点，做Meta要用哪些软件？含meta分析软件安装包！书接上回，之前我们在《meta分析的基本步骤是什么？附实例讲解，7步快速见刊策略》文章里详细给大家介绍了撰写一篇Meta分析需要经过哪些步骤。 今天我们就从这些步骤入手，给大...
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7.7分nature子刊，单基因泛癌分析与免疫治疗的关联大家好，今天要和大家分享的是2021年6月发表的一篇文章：“Pan-cancer analysis of SETD2 mutation and its association...
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8.4分非肿瘤生信，免疫浸润+机器学习+动物模型验证。可谓是非肿瘤生信结合实验验证的范文，值得收藏！生信小课堂 影响因子：8.44 关于非肿瘤生信，我们也解读过很多，主要有以下类型 1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因。2 单个疾病结合免疫浸润，铁死亡，自噬等基...
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[基因序列]序列比对专题
探序基因肿瘤研究院整理[https://cancer.tanxugene.cn] 1. BWA比对fastq测序序列 bwa mem -t 16 /xxx/database/...
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基因组组装----SOAPdenovo21.基因组组装的流程 基因组组装的大概流程如下： (1) 测序得到raw reads序列。 (2) Reads质量评估。 (3) 原始reads质控。 (4) 选择合适的参数...
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Linux | Conda安装及环境搭载-101conda是什么 Anaconda 是一个用于科学计算的 Python 发行版，支持 Linux, Mac, Windows, 包含了众多流行的科学计算、数据分析的 Pyth...
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细菌基因组拼接工具比较（二）2021.3.18持续更新中。。。目的：比较下目前常用的四款拼接软件：Velvet、SPAdes、SOAPdenovo、ABySS 1. FastQC —— 质量评估 Fas...
