你好,我想问做完后怎么呈现?
单细胞转录组差异表达分析——DEsingle上一篇说道SCDE包进行单细胞测序的差异表达分析。这一篇就来说说DEsingle这个包。1、安装先上包的官网链接https://github.com/miaozhun/DEs...
你好,我想问做完后怎么呈现?
单细胞转录组差异表达分析——DEsingle上一篇说道SCDE包进行单细胞测序的差异表达分析。这一篇就来说说DEsingle这个包。1、安装先上包的官网链接https://github.com/miaozhun/DEs...
单细胞富集分析系列: 单细胞之富集分析-1:单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...
练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
感谢楼主,这是我第一次在网上找代码去跑还没有任何报错的,感动
单细胞转录组数据校正批次效应实战(中)刘小泽写于19.6.24、29和花花毕业流浪,武汉完事转向成都继续进行剩下两个数据集 第二个数据--CEL-seq2, GSE85241 Muraro et al. (201...
有一点不懂的想要请教一下楼主:第三个数据的处理加载基因名称和表达矩阵处,为什么要做基因信息和表达矩阵的分离?
单细胞转录组数据校正批次效应实战(中)刘小泽写于19.6.24、29和花花毕业流浪,武汉完事转向成都继续进行剩下两个数据集 第二个数据--CEL-seq2, GSE85241 Muraro et al. (201...
请问分析单基因的代码那里,基因名称填在哪里呀?
TCGA学习03:生存分析TCGA学习01:数据下载与整理 - 简书 [https://www.jianshu.com/p/79816a20cbb1]TCGA学习02:差异分析 - 简书 [htt...
追问一下,如果要做PFS、RFS和DSS要怎么弄?
TCGA学习03:生存分析TCGA学习01:数据下载与整理 - 简书 [https://www.jianshu.com/p/79816a20cbb1]TCGA学习02:差异分析 - 简书 [htt...
TCGA学习01:数据下载与整理 - 简书 [https://www.jianshu.com/p/79816a20cbb1]TCGA学习02:差异分析 - 简书 [htt...
获取表达矩阵,处理TCGA的count数据,1表示为行。 导入数据 加 ENTREZID列,用于富集分析(symbol转entrezid,然后inner_join) 转化空格...
捉个虫,DSS是Disease Specific Survival的缩写不是楼主大大的Disease Free Survival
OS/PFS/DFS/DSS各种生存指标傻傻分不清各种生存分析-傻傻分不清 作者:白介素2 OS 总体生存期: Overall Survival 定义: 结局指标是死亡时间,这个死亡是任何原因导致的死亡都算进去,只关心是否死...
说明:此篇笔记系2016-2017年由克里克学院与康昱盛主办的蛋白质组学网络大课堂整理而成,侵删。该课程由上海交通大学系统生物医学研究院助理研究员库鑫博士所授。 主要知识点:...
系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法。在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常...
我忍不住笑了出来
简介和前期文章 我对之前的所有教程进行了再次详细的总结CRISPR-Cas9基因编辑之背景介绍及gRNA设计(上)[https://www.jianshu.com/p/e5c...
@春卷00 看到了,谢谢小姐姐
CRISPR-Cas9基因敲除实验步骤 Month 4 --可能的收官之帖(但还远未结束)我的CRISPR-Cas9基因敲除系列实验推文好久没更新了,中间遇到了不少问题,好在都算是一一解决了,细胞在今天早上也已经送出去做测序验证了,希望能有比较好的结果。今天将会把...
推荐小姐姐使用benchling(网页)哦,可以直接输入基因名或者导入genebank文件,靶序列以及各靶序列的on-target和off-target评分会直接出示,这个貌似也是张峰他们出的
CRISPR-Cas9基因编辑1--背景介绍及gRNA设计(上)简介和前期文章 我对之前的所有教程进行了再次详细的总结 前言: 每当我们接触新事物时,都忍不住问如下图所示之哲学三问(当然有时候问的是,这是什么?可以吃吗?怎么做?): 由于...
谢谢小姐姐哦,只会做慢病毒的我居然看懂了,好感动。老板为了中标书让我自学Cas9还要写技术说明,无人能请教头疼中看到小姐姐的推文,小姐姐简直就是一束光一般的存在
CRISPR-Cas9基因编辑2--gRNA设计(下)简介和前期文章 我对之前的所有教程进行了再次详细的总结CRISPR-Cas9基因编辑之背景介绍及gRNA设计(上) 前言: 在上一次文章中,我们已经得到了在线工具设计的sgR...
百度,有公司有卖的免费提供序列😂,这个貌似张峰团队无偿提供所有团队可以使用
CRISPR-Cas9基因编辑2--gRNA设计(下)简介和前期文章 我对之前的所有教程进行了再次详细的总结CRISPR-Cas9基因编辑之背景介绍及gRNA设计(上) 前言: 在上一次文章中,我们已经得到了在线工具设计的sgR...