"牛津纳米孔技术公司（Oxford Nanopore Technologies，ONT）开发的第三代测序平台是 目前唯一能够直接对天然RNA链进行测序的技术平台。ONT - ...
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全长转录组 | ONT Direct RNA测序 (DRS) 技术原理、数据分析和应用 -
DNA链方向上的小疑惑
虽然是做生物信息的，但是经常被一些基础性概念所困扰……而我又是一个强迫症，于是把这些乱七八糟的东西整理了一下，强行写了一篇小文章。东西太杂，但是彼此相关，实在想不到什么合适的...
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链特异性建库如何区分正负链？写在前面的废话 经过这两周意外的断更，我明白了一个道理，人都是具有惯性的…… 两周没写公众号，我似乎都习惯了懒惰，文章不想更了，笔记也懒得记了。 但是我没忍住双十一的诱惑，一...
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tf.nn.sampled_softmax_loss的计算原理
可以看作是Softmax计算的另一种加速。 （注意区分下Word2Vec的huffman softmax） 在正常每个time-step输出的时候，我们使用的是直接在整个字典...
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Python中list的实现
原文链接 这篇文章介绍了Python中list是如何实现的。在Python中list特别有用。让我们来看下list的内部是如何实现的。来看下面简单的程序，在list中添加一...
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python篇---看面经总结(总结中)
1.python中list底层怎么实现的先看下面的程序 cpython中，list对象的结构是： List initialization初始化：返回l = []ob_size...
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Bert系列（三）——源码解读之Pre-train
pre-train是迁移学习的基础，虽然Google已经发布了各种预训练好的模型，而且因为资源消耗巨大，自己再预训练也不现实（在Google Cloud TPU v2 上训练...
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Bert模型tensorflow源码解析（详解transformer encoder数据运算）Github地址：https://github.com/1234560o/Bert-model-code-interpretation.git Contents 前言 模型输...
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Pandas-DataFrame基础知识点总结1、DataFrame的创建 DataFrame是一种表格型数据结构，它含有一组有序的列，每列可以是不同的值。DataFrame既有行索引，也有列索引，它可以看作是由Seri...
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Tensorflow 的NCE-Loss的实现和word2vec
这两天因为实现mxnet的nce-loss，因此研究了一下tensorflow的nce-loss的实现。所以总结一下。 先看看tensorflow的nce-loss的API：...
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浅谈BCR及TCR基因的克隆重排
最近纠结于许多临床医生和病理医生关于BCR和TCR基因重排检测的一些疑问，比如：某多发性骨髓瘤患者检测到IGH-V区的单克隆重排，该结果是否与他血清免疫固定电泳结果是IgA型...
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Label Distribution LearningPaper Reading Note URL: https://arxiv.org/abs/1408.6027 TL;DR 本文提出了一种新的学习范式：label distr...
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基因ID转换方法总结1. clusterProfiler包，bitr()转换ID函数 clusterProfiler 是Y叔写的一个功能强大的R包，可以用来做各种富集分析，如GO、KEGG、DO...
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spark中cache()、persist()、checkpoint()解析
“夫唯兵者，不祥之器，物或恶之，故有道者不处。君子居则贵左，用兵则贵右。兵者不祥之器，非君子之器，不得已而用之，恬淡为上。胜而不美，而美之者，是乐杀人。夫乐杀人者，则不可得志...
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Attention Is All You Need简记(多头注意力、自注意力、层归一化、位置嵌入)首先注意力模型可以宏观上理解为一个查询（query）到一系列（键key-值value）对的映射。将Source（源）中的构成元素想象成是由一系列的<Key,Value>数据对...
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交叉验证，K折交叉验证的偏差和方差分析交叉验证 犀利的开头 在机器学习中，我们用训练数据集去训练(学习)一个model(模型)，通常的做法是定义一个Loss function（误差函数），通过将这个Loss(或者...
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Docker 联合文件系统(Union Filesystem)Dockerfile、Image、Container Dockerfile: 用于描述镜像的生成规则。 Dockerfile中的每一条命令，都在Docker镜像中以一个独立镜...
