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    《全网超全的保姆级 GSEA 代码教程》

    1 帮师姐做了 GSEA 的相关分析,发现有几点比较容易出错,可以注意一下: 1 GSEA 的 input 是没进行过筛选的 DESeq2 差异表达分析的结果,只是通过 lo...

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    WGBS 下游分析

    下载CpG 岛的文件fromUCSC,不过坐标系统需要处理一下: methylKit Tutorial link:https://bioconductor.org/packa...

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    WGBS 上游分析

    0.Introduction to the Principle of WGBS Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) is a h...

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    CHIPseeker 注释 peak

    在 macs2 callpeak 之后,我们想要知道:the distribution of peaks, like intron/exon and so on.So we ...

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    Bulk-seq analysis

    1.下载 ensembl 参考基因组和注释: 2.STAR 生成索引文件 3.STAR Mapping slurm 脚本: 4.FeatureCount生成 rawcount...

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    一个简单的方法下载 TCGA 中的 MAF 文件

    0. open this website 1.页面如下 2. 点击 Data Sets,输入你感兴趣的 Cancer type,这里我的选择是:Breast Invasive...

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    WES 实战

    全外显子组测序(Whole Exome Sequencing, WES)技术简介 定义与原理 全外显子组测序(WES) 是一种高通量测序技术,专注于对人类基因组中 外显子区域...

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    《GSEA富集图(Enrichment Plot)解读指南》

    图片来自https://www.biostars.org/p/367191/[https://www.biostars.org/p/367191/] 第一部分富集曲线: 富集...