一 基础知识 1、什么是富集分析？ 富集分析的原理一个生物过程通常是由一组基因共同参与，而不是由单个基因独自完成。富集分析的基本前提假设是，如果一个生物学过程在已知的研究中发...
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IP属地：广西
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基因功能富集 -
偶尔更新，需要沉淀
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一个R包搞定22种单细胞基因差异分析参考文献：Confronting false discoveries in single-cell differential expression[https://doi.o...
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R语言向量元素的增删改查基本操作
增 R语言的索引是从1开始的 当我们访问不存在的索引的时候，他不会报错，而是以NA代替，类似于python里面的None,大家注意比较一下！在这里，我直接为索引为5的元素赋值...
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一条小咸鱼
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最大似然法 （1）基本原理以下内容都是基于Christopher P. Randle教授在研究组上交流时的课件整理而来。 最大似然法选择的最优树是使得观察到的性状分布（character state ...
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泛基因组 | 简介一、什么是泛基因组？ 2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念（pangenome，pan源自希腊语‘παν’，全部的意思），泛基因组即。2009 年，Li等...
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RPKM、FPKM、TPM详解
简写 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千个碱基的转录每百万映射读取的rea...
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刚入门生物信息的研究僧，目前就读于海南大学，在中国热带农业科学院橡胶所进行实验，本简书账号发布一些生信学生过程中的笔记与广大生信人一起交流学习。有问题或者是交流请联系邮箱:linxianzu1995@163.com
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RPKM，FPKM和TPM明确解释
RPKM，FPKM和TPM明确解释| RNA-Seq博客 来自StatQuest 过去，当您进行RNA测序时，您以RPKM（Reads Per Kilobase Millio...
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GWAS分析 (一)接触全基因组关联分析（GWAS）已经一年半有余，从刚开始对GWAS的全然无知到现在慢慢了解，越来越能体会到这项技术的了不起。同时，越来越多的科研工作者也在使用这项技术，然后就...
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高通量测序领域常用名词解释【转】
作为一个已经在生物信息行业摸爬两年的小白，还是有必要重新认识一下高通量测序领域的一些常用名词。什么是高通量测序？高通量测序技术（High-throughput sequenc...
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全基因组关联分析 (GWAS) - 简介在硕士就读期间，就已经做过 GWAS 相关的分析。当时标记量非常少， windows 系统分析就足够了，作图方面涉及的脚本也基本是蔡师兄帮写的。后来，随着高通量测序成本的降低...
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实验技术（1）——载体构建相关常规载体构建原理及流程较为简单，具体操作也比较容易。这里进行简单总结，并对几点需要注意的点进行说明。 原理依赖于限制性核酸内切酶，DNA连接酶和其他修饰酶的作用，分别对目的基...
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决定用四年的时间记录自己的成长；<br>女孩子也可以努力的很漂亮；<br>喜欢的东西都很贵，所以要加油呀。<br>VX公共号：学生菌口替代表
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RT-PCR，QRT-PCR，real-timePCR之间的区别
PCR：一种快速的DNA复制方法,由变性--退火(复性）--延伸三个基本反应步骤构成。 RT-PCR：反转录baiPCR(reverse transcription-PCR)...
