targetScan 基于文献《Prediction of Mammalian MicroRNA Target 》中的叙述，往往通过miRNA的 seed region（5‘...
IP属地：山东
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小结miRNA与mRNA/lncRNA互作的工具
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Python爬虫，批量获取知网文献信息一、前言 最近临近毕业，写毕业论文需要从知网查找大量的文献。但去知网一条一条进去看摘要又略显麻烦和浪费时间。于是，反手写一个爬虫，批量获取基本信息，岂不美哉？在开始这个项目之...
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生物信息学专业<br>公众号：生信学习手册
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研究方向：基因组学、转录组学、遗传学<br>边做边分享，超不定期更新
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转录组趋势分析基本概念 表达趋势分析（Series Test of Cluster）：将变化特征模式相似的基因归类到一种变化趋势中，从而找到实验变化过程中最具有代表性的基因集以及对应的趋势...
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如何获取染色体长度我们在做基因组或者转录组数据分析的时候，经常需要用到染色体的长度。今天我们就来聊聊如何获取染色体的长度。我们以人的为例，给大家介绍两种不同的方法，都要用到著名的公共数据库UC...
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植物基因组数据库
| Database | URL | Species || RARTF | http://rarge.gsc.riken.jp/rartf/ | 拟南芥 || AGRIS, ...
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生信、AI、大数据、育种。MiyuanBiotech
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【Pathview web】通路映射可视化前言 pathview是一个通路可视化友好的R包，最主要的是它支持多组学数据映射（基因/蛋白-代谢）。自己用过它的R包，后来发现有网页版的，果断介绍给学员。因为不常用，记录要...
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使用Cytoscape中的Enrichmen进行富集分析可视化tMapEnrichment Map是一个用于功能丰富可视化Cytoscape软件的插件,必须使用任何可用方法在EnrichmentMap之外生成富集结果。将基因集（例如通路和Gen...
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富集分析结果展示（二）——富集分析圈图“做cox比例分析和KM曲线结合分析，阈值该怎么选取，数据是否需要标准化等等问题的解决方法” 01—研究背景 对基因功能富集结果的展示有很多种展示方法，有人说气泡图展示富集结...
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零代码差异表达分析, DESeq,limma,edgeR一网打尽
作为一个生物学家(zha)，差异表达分析似乎是一项必备的技能。然鹅对于一个没有任何编程基础的生物学家，写代码是那么神秘莫测而又遥不可及，让人脑壳疼。那么今天小编就为大家介绍一...
