IP属地：河北
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转座子（TE,散在重复）特征及其对基因组影响基因组中重复序列大体分为两类：串联重复（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可预测）散在重复（Dispersed repeats），...
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博主大大，我想问一下DupGen_finder鉴定出来的部分基因不属于任何复制类型，也没出现在singleton文件里这正常吗😭
基因组基因复制的分类鉴定：DupGen-finder
参考：https://www.jianshu.com/p/0a14d971bd0a[https://www.jianshu.com/p/0a14d971bd0a] requi...
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博主大大，我想问一下DupGen_finder鉴定出来的基因不属于任何复制类型，也没出现在singleton文件里这正常吗
「基因组」基因组分析之鉴定基因类型
基因类型鉴定 基因组的组装和注释完成，得到配套的基因组和注释文件之后，可以利用gffread软件提取对应的gene的cds，pep序列。应运而生，下游的生信或者实验想知道关注...
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使用clusterProfiler进行GO、KEGG富集分析（有参情况）寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显，这些差异的基因必然与功能改变密切相关，例如，比较患病个体与正常个体的组织表达谱，不难想到这些显著...
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大大，俺的非模式物种建好包后，后续使用引用他的时候显示不存在该包是啥情况😭
GO，KEGG，DO富集分析
这是我听B站鲮鱼不会飞视频（GO，KEGG，DO富集分析）里的笔记哦~当然有的地方加上的是我自己的理解，如果哪里和视频上讲的不一样那是我自己发挥的，自行忽略.... 市面上公...
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您好，我想问下代码运行之后gene_id.txt中变成空白的了是什么原因呀
生信笔记01：Locus tag转换为Entrez Gene ID
最近在做KEGG富集时遇到一个问题：phytozome上的数据采用的注释为Locus tag，但是kobas3.0并不支持这一类型，如此需要进行转换。如果是常见的模式物种还好...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
