最近有人问起单细胞测序分析的问题,我确实没有做过,就先来学习一下吧。先在搜狗微信找到一些介绍引用一下: 单细胞测序有着漫长的过去,却只有短暂的历史—-谁说的! 说她漫长是因为...
SnpEff : 突变位点注释 参考教程: https://www.jianshu.com/p/ad1ab3d7fcd0 SnpEff下载链接: http://snpeff....
ANNOVAR 注释软件注释过滤 其实之前也学习了点相关内容外显子数据处理笔记 3 ANNOVAR | 注释但当时没有好用的服务器,很多操作都没能完成。今天来重新学习一下。 ...
R统计 安装加载必要的R包 QUALITATIVE DATA QUANTITATIVE DATA 卡方检验,Fishers检验 T检验 Graphical explorati...
1.拿到数据后先检查数据是否完整。用md5sum命令。 2.对数据进行质检。 3.与参考基因组进行比对。为什么要比对?我们已经知道NGS测序下来的短序列(read)存储于FA...
分析流程 1.上传四个样本原始就文件到服务器 参考https://www.jianshu.com/p/a84cd44bac67[https://www.jianshu.com...
运行成功就不用管这个wran吗
gatk BaseRecalibrator 报错gatk报错 12:23:54.895 WARN IndexUtils - Feature file "/public/biosoft/GATK/resources/bun...
1. 查看后台运行的命令 有两个命令可以来查看,ps 和 jobs。区别在于 jobs 只能查看当前终端后台执行的任务,换了终端就看不见了。而ps命令适用于查看瞬时进程的动态...