学习生物学，一项很重要的事情就是理解概念。有一种方法就是直接从名字上理解概念。小RNA，是不是就是很小的RNA？宏基因组，是不是就是很“宏”的基因组？……答案很统一：必须是啊...
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群落多样性之Alpha多样性（一）
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低级生物信息工程师。<br>仅限于学习交流用途，请勿打赏！<br>
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R语言学习（一）——下载R包小小白一枚，整理并分享一下自己在学习R的时候一些心得与体会！如果有说的不对的地方还请各位大佬指正交流~ R语言是生信分析中经常会用到的数据工具之一，学好R语言将会为我们之后的...
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ggplot2再话箱线图之几何填充有观众老爷询问如何对箱线图进行几何形状填充，那么今天就来具体介绍一番；在原有的基础上做了一些小的改动也许恰好您正好有此特殊需求，需要着重体会八个字变实为虚，变虚为实，希望对各...
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跟着Nature学作图：R语言ggtree给进化树的节点添加饼状图论文 Galeaspid anatomy and the origin of vertebrate paired appendages https://www.nature....
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nature microbiology图表复现之聚类条形图本节来复现nature microbiology上的一张带聚类的条形图，图均基于ggplot2,ggtree，通过jjAnno很轻松的添加了阴影，下面来进行具体介绍，数据代码...
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R语言graphics绘图原理graphics包也称为传统绘图系统，一些基本绘图函数均由该包提供。在最初安装R软件时，该包就已经安装在R程序中，其中的绘图函数可以直接使用，而不必加载graphics包。g...
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个人wx公众号：木舟笔记。
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跟着 Cell 学作图 | 主坐标分析(PCoA)及其可视化（vegan）跟着 Cell 学作图 | 主坐标分析(PCoA)及其可视化（vegan） Title：Targeted suppression of human IBD-associate...
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复旦师兄，wx公众号【生信师兄】
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生信常用分析图形绘制01 -- 各种类型的热图！有了R语言的基础，以及ggplot2绘图基础，我们的生信常用分析图形的绘制就可以提上日程了！本系列，师兄就开始带着大家一起学习如何用R语言绘制我们自己的各种分析图吧！ 由于本...
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初学统计分析，一起学习交流
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研究生一枚，主要研究方向为植物内生菌及微生物相关内容，公众号【科研后花园】，主要更新内容：1）基于R的科研绘图；2）科研小技巧分享；3）绘图技巧分享；4）科研网站分享。
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基于R语言的微生物群落组成多样性分析——CCA分析之前文章中我们讲到过冗余分析（redundancy analysis, RDA），今天我们来讲另一种分析——典范对应分析（canonical corresponden...
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非约束排序1—概述 （数量生态学：R语言的应用第五章）
非约束排序1—概述 （数量生态学：R语言的应用第五章） 在这之前我们已经学习了聚类分析，聚类分析的目的在于寻找数据的间断性，排序的目的就在于寻找数据的连续性（通过连续的排序轴...
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R package：ggplot2画中国地图1.安装包 2.读取地图 2.1读取省界地图 2.2读取市界地图 2.3读取县界地图 面积（AREA），周长（PERIMETER），各种编号、中文名（NAME）等字段。其中中...
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《数量生态学：R语言的应用》第二版第三章-关联测度与矩阵------Q模式第三章-关联测度与矩阵------Q模式 生态学涉及多元统计方法，特别是排序和聚类，都是明确或不明确地基于所有可能对象或者变量之间的比较。这些比较通常采用关联测度（assoc...
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《数量生态学：R语言的应用》第二版阅读笔记2第二章-第二部分-生态数据转换 数据转化的目的： 使不同物理单位的变量具有可比性(可以利用归一化，z-scores标准化，即先中性化再除以标准差，让变量无量纲化，然后方差就可...
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《数量生态学------R语言的应用》第二版阅读笔记1赖江山老师《数量生态学------R语言的应用》第二版阅读笔记1 本次是第一章绪论和第二章绘图部分 绪论 生态学（Ecology）是研究有机体及其周围环境相互关系的科学。 读...
