Venn图经常用于表现组间重叠元素的数量信息。但是随着分组数量的增多，Venn图的结构会越渐复杂，如下所示，当分组数量为5组时，已经不容易从中识别交集概况了。因此，这也是为什...
IP属地：江西
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Venn图难以展示大于5组的集合怎么办？用UpSet图表示 -
生信分析中常用的R语句
一、前言 好难受，今天的R崩了、昨天才安装的包怎么报错了、为啥我装了这个包没反应，什么鬼怎么又乱码了。这玩泥巴(╯‵□′)╯︵┻━┻不行要佛系生活，好久没写简书了，还是来整理...
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如何防止机器学习模型的过拟合（翻译笔记）
How to Prevent Overfitting in Machine Learning Models Very deep neural networks with a ...
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R：setwd()与getwd()
在R中我们主要用到的就是setwd()与getwd()这两个函数，来设置好工作目录。 1 setwd() 顾名思义，它是原来设置当前工作目录的，注意调用格式为：setwd("...
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公众号 生信小课堂
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RNA-seq入门实战（五）：差异分析——DESeq2 edgeR limma的使用与比较本节概览：1.DESeq2、 edgeR、limma的使用2.三类差异分析软件的结果比较——相关性、韦恩图3.选取差异基因绘制火山图和热图 承接前期文章：RNA-seq入门实...
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TCGA数据挖掘入门---什么是TCGA？TCGA中有哪些数据？
1. 什么是TCGA？TCGA中有哪些数据？ TCGA的全称是The Cancer Genome Atlas, 这个项目始于2005年，它旨在使用基因测序和生物信息学编目与癌...
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记录和分享工作、科研上的技能和方法！在此之余，也希望能帮到有同样疑问的小伙伴！<br>微信公共号：YJY技能修炼<br>特别喜欢的一句话: 生如蝼蚁当立鸿鹄之志，命薄似纸应有不屈之心。
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拟时序分析简要内容--拟时序分析的定义--结果解读--------做出结果（cluster、state）--------确定起始点--------做start····end的图（并且映...
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【生信基础】深入理解FPKM/TPM，只有GTF文件如何将count转为FPKM/TPM相信学习生信的小伙伴不难发现，在定量的时候大多的文章或者公司的结果都有这几种定量的方式：FPKM（RPKM），TPM，CPM(RPM)还有count等等，这些究竟该如何使用，...
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CRISPR-Cas9基因编辑7--测序验证敲除前言： 使用挑单克隆技术得到多个单克隆细胞系后，就要开始验证敲除，除了蛋白表达水平的检测，最终还是要看测序结果。关于测序的方案也是各有不同，由于之前选用的是CRISPR-Ca...
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研究生在读<br>渣渣学生在好的学校里挣扎争取毕业中
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当在谈临床预测模型时候，我们究竟在说啥?临床资料收集： 1.提出科学问题 2.收集临床资料 3.选择合适统计学方法 4.选择合适的统计软件 5.评估结果，结合专业知识回答科学问题 这个框架真的很好用的，我在间接性残...
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STRING数据库的蛋白质相互作用（PPI）网络分析在转录调控相关的文献中，我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络（protein protein interaction network，PPI network）。具体而言，...
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搞科研，什么都不配，进了实验室我就是王，出了实验室就是舔🐶一枚，经受着社会在身上不断的摩擦，反抗不了，只能学着享受。
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铁死亡研究进展（四）。
逐渐爆发的2019年。 1.败血症是一种威胁生命的疾病，由对感染的异常免疫反应引起，可导致组织损伤，器官衰竭和死亡。Erastin是一种能够引发癌细胞中铁死亡的小分子。然而，...
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We'll do whatever just to stay alive.
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如何理解Type I/II Error，敏感性与特异性以及ROC，AUC（2019-12-16） 首先，Type I/II Error 在维基百科的解释为： Type I error is the rejection of a true null...
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