一、 重要参数，属性与接口（RandomForestRegressor）回归 所有的参数，属性与接口，全部和随机森林分类器一致。仅有的不同就是回归树与分类树的不同，不纯度的指...
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随机森林02 -
随机森林如何处理缺失值
序 RF中有相应的缺失值处理方法，本次记录其两种缺失值处理技巧 暴力填补 Python中的na.roughfix包提供简单的缺失值填补策略：对于训练集中处于同一个类别下的数据...
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有相关性就有因果关系吗，教你玩转孟德尔随机化分析（mendelian randomization ）
流行病学研究常见的分析就是相关性分析了。 相关性分析某种程度上可以为我们提供一些研究思路，比如缺乏元素A与某种癌症相关，那么我们可以通过补充元素A来减少患癌率。这个结论的大前...
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单细胞测序数据整合练习（详细代码）最近在学习芬兰CSC-IT科学中心主讲的生物信息课程(https://www.csc.fi/web/training/-/scrnaseq)视频，官网上还提供了练习素材以及详...
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GATK4全基因组数据分析最佳实践,我以这篇文章为标志,终结当前WGS系列数据分析的流程主体问题 | 完全代码这是我根据之前的WGS系列和GATK4实践文章进行重新梳理之后确定下来的分析流程，这是一个WGS的最佳实践，它基于GATK4和我的实际经验，稍作修改即可应用到实际的项目中。我...
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这篇3+分教你筛选拿出来几个基因应该如何分析今天和大家分享的是2020年发表在CancerCell Int（IF：3.439)上的一篇文章，“Constructionof a novel gene-based mode...
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筛个差异基因为什么就7分了？
今天跟大家分享的是2019年3月发表在J.Crohns.Colitis （IF：7.827）杂志上的一篇文章High-Throughput Identification of...
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用于进行Meta分析以合成相关数据的非技术性入门上期我们谈到了系统综述和Meta分析的常用软件工具，今天我们就来重点解析一下Meta分析的方法步骤。 Meta分析是对具备特定条件的、同课题的诸多研究结果进行综合的一类统计方...
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meta分析的分类简介（学习记录）
今天学习了meta分析的分类，做了一些笔记，记录于此。 meta分析是什么？ 证据是循证医学 (Evidence-based Medcine，EBM) 的核心，基于随机对照试...
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Anaconda多环境多版本python配置指导
Anaconda是一个优秀的开源Python发布版本，由于中文社区对这个软件的介绍及教程比较少，还是官方文档比较详细，在此翻译如下。 原文地址：http://conda.py...
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GWAS基本分析内容之前给大家大致介绍了GWAS在临床生信分析中的概况，包括一些基本概念，原理和注意事项（出门左手边—>临床生物信息学中的GWAS分析），这次具体讲讲GWAS基本分析内容及结果解...
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跑通GWAS，用这些脚本就够了最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，虽然具体还有好多需要微调的地方，先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈推荐百迈客云课堂课程GWAS生...
