相关性分析 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程...
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R相关性分析和相关性热图 -
序列比对工具 | BLAST、 BLAT、 diamond基本概念 相似性（similarity） 一种很直接的数量关系，比如部分相同或相似的百分比或其他一些合适的度量 如：A序列和B序列的相似性是80% 同源性（homology）...
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R 数据可视化 02 | 火山图
一. 示例数据准备 下载：链接：https://pan.baidu.com/s/1tKR943efKOn7-TW_892KLg提取码：wbk6 文件说明示例数据，其中数据均为...
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使用KaKs_calculator计算Ka/Ks的一个小实例更新20181216 今天又把KaKs_calculator2.0的帮助手册翻出来看了一遍，找到了一句话：Before calculation, gaps and stop ...
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中科院硕博生一枚，用简书来记录自己精读paper和学习生信的过程。
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使用TBtools绘制进化树+motif分析+基因结构~三图合一今天推文的内容重点是画图用到的输入文件的准备image.png 图一 基因家族分析的论文中通常会把基因家族成员的进化树、基因结构、motif分析放在一张图里。效果如图一。准备...
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GO注释和富集分析概念介绍
什么是富集分析？ 当我们获得了一批生物数据时，例如转录组的数据，蛋白质组的数据，其中必然要做不同样本之间的差异基因分析这一步，例如空白对照组与实验组的差异基因或蛋白分析。在得...
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R语言入门1：安装R和RStudio1. Windows安装R 在Windows系统上，安装R语言比较简单，直接从R的官方网站下载，按照正常的软件安装流程点下一步即可。 2. Windows安装RStudio ...
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
