
该R包由国外友人Enblacar完成,目前处于预印本阶段,旨在提供一种简化的方式,为已知的单细胞可视化生成可发布的图形。与“审美愉悦”一词一样主观,这是一组跨不同情节类型实施...
批次效应 批次效应是测量结果中的一部分,它们因为实验条件的不同而具有不同的表现形式,并且与我们研究的变量没有关系。不同平台的数据,同一平台的不同时期的数据,同一个样品不同试剂...
安装包 使用内置数据 使用Hierarchical clustering的方法去看一下聚类的情况 校正批次效应,model可以有也可以没有,如果有,也就是告诉combat,有...
差异表达分析内容:• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts,RPKM,FPKM,TPM➢ PCA图、热图等• 差异表达分析及可视化➢ limma-voom,edge...
在我之前的帖子单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释里面,我已经介绍了如何使用SingleR给单细胞数据做注释,当时只讲了SingleR配套的参考集。这次就讲讲如...