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等位基因特异性表达(ASE)及顺反式调控研究的相关分析整理
在对动植物杂交种（或F1子代）的基因组和转录组的关联研究中，要回答这么一个问题：基因组变异到底与基因表达有什么关系？ 这个问题很难，因为涉及影响基因表达调控的因素可太多了！多...
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基因组装 | hifiasm 输出结果文件细究基因组组装这块我看的不是很多，尽管也看过一些资料，跟朋友也讨论过。但仍然感觉理解不够深入。索性，自己直接肉眼看看，或许更为实在。 hifiasm 输出结果有哪些？ 一般来说，...
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跟着Nature Communications学作图：R语言circlize包做漂亮的弦图论文 A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marine fishes https://www.nature.co...
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跟着Nature Communications学数据分析：基因组水平的比对鉴定结构变异论文 Pan-genome inversion index reveals evolutionary insights into the subpopulation stru...
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使用MapMan分析水稻基因功能
MapMan是老牌的植物基因功能分析工具，早期是针对基因芯片数据设计，现在可以用于各种模式植物或非模式植物基因集的功能分析，并且该软件一直保持着更新。 完成MapMan分析，...
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植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman 关键词： 植物 代谢通路 基因表达 Mapman 你可以对基因进行功能注释，分析其功能分类以及相关的通路信息，你也能分析...
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【第 0 章 绪论】作物育种学总结笔记
作物生产改良途径：作物遗传改良、作物生长条件改善 第一节 作物进化与遗传改良 一、作物品种的概念 1. 品种（variety/cultivar）：人类在一定生态条件和经济条件...
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KASP标记与农作物育种KASP的特点 在过去30 年中，分子标记从低通量限制性片段长度多态性（RFLP）开始，到最近达到的基于NGS 技术的SNP 标记，已经经历了三代。竞争性等位基因特异性PCR...
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SSRminer | 微卫星分子标记开发，我64秒搞定~写在前面 如果说在湿实验的主要研究方向上，我还有没太接触的，那么就是“跑大版胶”，开发分子标记。于是，这一块相关功能，我并没有太多想法开发。只是最近开始接触一些群体遗传相关教...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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如何对SNP设计引物: CAPS, dCAPS最近一直在帮师姐根据SNP找基因组上的酶切多态位点，然后给她提供该位点附近1kb的序列，让她去设计引物。由于我本科就做过一点点的遗传定位，当时用的是SSCP(单分子构象多态性...
