常用的分析方法: 过表征分析 (over representation analysis, ORA) :先找出差异基因,再对差异基因进行如GO/KEGG等富集 基因富集分析 ...
R是一个惊艳的图形构建平台,这也是R语言的强大之处。本文将分享R语言简单的绘图命令。 本文所使用的数据或者来自R语言自带的数据(mtcars)或者自行创建。 首先,让...
在本次练习中,我们通过一个简单的例子,快速了解ggplot2作图的思想。 1.ggplot2的安装 通过以下命令,安装ggplot2包 2.数据的准备 在ggplot绘图的艺...
最近用之前写的R脚本重新跑数据时,出现了报错。经检查,才发现是数据的列名读入R时发生了变化,列名前自动加上了X.符号。 read.table系列函数有一个check.name...
geom_line: 按变量在x轴上的顺序连接 geom_path: 按变量在数据中出现的顺序连接 折线图的美学映射有: x y group alpha size linet...
1. 条形图 语法在R语言中创建条形图的基本语法是 - 以下是所使用的参数的描述 --- H是包含在条形图中使用的数值的向量或矩阵。-- xlab是x轴的标签。-- ylab...
感觉100年没有上简书,近2个月忙于毕业论文以及公众号推文,没有时间更文章。终于前几天交了论文呢,可以回来更文了。没错我只是在为我的懒惰寻找接口,今天我们来讲一下桑基图(Sa...
在ceRNA相关的研究中,例如circRNA-miRNA-mRNA,或者lncRNA-miRNA-mRNA的靶向关系图谱,一般通过网络图呈现。首先可以肯定的是,网络图是一种清...
本文使用某宏基因组测序数据中的种水平类群丰度表,并直接根据所有种相对丰度总和,提取出top10丰度的种类群,作图展示这些种的丰度组成,top10外的类群合并为“Others”...