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每次有正事的时候就想逃避写个简书，假装自己没有干不正经的事。（明明我还有一些数据需要分析呢，但是毫无分析的动力。）好的，今天我们来介绍一个很酷炫的图：弧形图（Arc Diag...

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单细胞转录组学已经改变了我们表征细胞状态的能力，但对生物学更深入的理解需要的不仅仅是对细胞进行简单分类。 随着测量细胞不同维度信息的新方法的出现，一个关键的分析挑战是整合这些...

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跟着 Cell 学作图 | 3.箱线图+散点+差异显著性检验 “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1016/j.cell.2020...

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跟着 Cell 学作图 | 2.柱状图+误差棒+散点 “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1016/j.cell.2020.05....

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今天我们复现一幅2020年发表在Cell上的热图。 DOI:10.1016/j.cell.2020.07.009 22 读图 将不同样本的基因表达情况用热图展示并将倍数变化条...

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论文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...

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本系列课程要求大家有一定的R语言基础，对于完全零基础的同学，建议去听一下师兄的《生信必备技巧之——R语言基础教程》。本课程将从最基本的绘图开始讲解，深入浅出的带大家理解和运用...

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论文 Large variation in the association between seasonal antibiotic use and resistance ac...

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hello，大家好，今天我们来实现一下下面的这张热图 我们最关注的就是图的右边只标记感兴趣的基因，如何实现呢？？？ 准备作图文件 接下来，让我们来实现一下上面的热图。 为了绘...

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导读 在R语言中用expression参数可以给画图函数中的xlab或者ylab的标签添加上下标。 方法 expression("标签"["下标"]^"上标") 使用par控...

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以下是B站生信技能树GEO数据库挖掘的课程笔记 主要内容及学习目的： 介绍GEO数据库：了解数据存放位置； 介绍GSE项目的3种下载方式； 介绍ID转换：使用R语言技巧实现基...

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ggtree是R语言里对进化树进行可视化展示的一个功能非常强大的R包，ggtree的作者还专门写了一本书对ggtree的用法进行了详细的介绍，相关链接是 https://yu...

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R语言与统计-1：t检验与秩和检验[https://www.jianshu.com/p/ba629f6ae85d] 1. 基础知识 方差分析适用于多组均数的比较（在完全随机设...

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方差分析是小编工作中最常用到的统计分析方法，以往对于这个分析方法总是懵懵懂懂，在学习《R语言实战》的过程中发现只有对统计知识的原理学深学透，才能在运用R进行分析时做到知其然并...

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在医学研究中，我们经常构建回归模型来分析自变量和因变量之间的关系。事实上，大多数的回归模型有一个重要的假设就是自变量和因变量呈线性关联，这个条件实际很难满足。常见的解决方法是...

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简书：没有生物学重复的转录组数据怎么进行差异分析？ edgeR需要的数据是reads数，可以设置BCV值，做单样本的差异分析。edgeR包可以做无重复的差异分析，不过需要认为...

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数据分析 数据统计与计算 本节讨论使用Pandas来对数据进行处理和分析，主要包括以下内容 获取数据的统计信息 显示数据类型 转换数据类型 去除数据的重复值 对数据进行分组 ...

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跟着Cell学作图|7.富集分析(Metascape数据库) “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1016/j.cell.2020...

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一、Metascape简介 Metascape（http://metascape.org/[http://metascape.org/]） 是一个功能强大的基因功能注释分析工...