单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异，因此，功能分析在单细胞分析中相当重要. 功能分析的方法很多，这儿我们主要讲述3种功能分...
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单细胞转录组功能分析（超详细clusterProfiler,GSEA,GSVA分析） -
PCA 解释方差骤降图（ElbowPlot）拐点的量化识别单细胞PCA降维的时候，肘部图(ElbowPlot)上显示排名较高的 PC 比排名较低的 PC 解释了更多的数据差异（具有更高的标准差）。PC的解释方差变化趋势属于非线性曲线...
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CIBERSORT：反卷积推测bulk中的细胞类型五一学了一个新的分析方法-CIBERSORT，这个包其实很早就想学的，因为现在一般的单细胞文章的套路，很难不用到它，那么它能干什么呢？它能够推测出bulk RNA每一个样本中...
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ssGSEA 与CIBERSORT分析--肿瘤免疫浸润分析背景 GSEA、GSVA、ssGSEA和GO、KEGG富集分析之间的区别？ 从输入的表达矩阵入手1. GSEA的输入矩阵：差异表达分析后得到的矩阵！一列基因名/ENTREZ ...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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